Chapitre 6 - La résistance aux antibiotiques chez les animaux sauvages. Exemple de la Guadeloupe

Stéphanie Guyomard-Rabenirina, Yann Reynaud, Matthieu Pot, Emmanuel Albina, David Couvin, Célia Ducat, Gaëlle Gruel, Séverine Ferdinand, Pierre Legreneur, Simon Le Hello, Édith Malpote, Syndia Sadikalay, Antoine Talarmin et Sébastien Breurec

p. 63-78

Résumé

On dispose de peu de données sur la contribution de la faune sauvage à la propagation de la résistance aux antibiotiques. Ce chapitre présente les résultats d’une recherche menée en Guadeloupe par une équipe de microbiologistes de l’Institut Pasteur, qui avait pour finalité de déterminer la prévalence de la résistance aux antibiotiques dans les isolats d’Escherichia coli collectés chez les animaux sauvages (iguanes, oiseaux, anoles, rongeurs) entre 2013 et 2014, et la base génétique de la résistance aux céphalosporines de troisième génération.

Note de l’éditeur

Ce chapitre est traduit d’un article en anglais paru dans la revue internationale Frontiers in Microbiology de juillet 2020 :

Antimicrobial resistance in Wildlife in Guadeloupe (French West Indies) : distribution of a single blaCTX–M–1/IncI1/ST3 plasmid among humans. Frontiers in Microbiology, vol. 11, 20200710. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01524 .

Remerciements

Nous remercions tous les techniciens et étudiants impliqués dans ce travail à l’Institut Pasteur de Guadeloupe, au CHU de Pointe-à-Pitre, et au Cirad - UMR ASTRE. Nous remercions également Elisabeth Heseltine pour son aide à la rédaction.


Extrait

1La résistance aux antibiotiques (AMR) est devenue une menace majeure pour la santé humaine dans le monde entier, entraînant une augmentation spectaculaire de la morbidité et de la mortalité (Laxminarayan et al., 2013). L’AMR est un problème complexe, à multiples facettes, qui implique les humains, les animaux et l’environnement.

2Le rôle de la faune sauvage dans la propagation de la résistance aux antibiotiques est sous-estimé. Depuis la première description, en 1977, d’isolats de la bactérie Escherichia coli résistants au chloramphénicol chez des oiseaux sauvages japonais (Sato et al., 1978 ; Wang et al., 2017), la présence de bactéries résistantes aux antibiotiques dans la faune sauvage est de plus en plus souvent signalée chez diverses espèces animales, dans un large éventail d’habitats et de lieux30.

3La plupart du temps, il s’agit d’une exposition indirecte de la faune sauvage aux bactéries résistantes

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