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    Plan détaillé Texte intégral Les approches différenciées L’Herbier Marie-Victorin : une approche artisanale La Global Plants Initiative : la sous-traitance et la standardisation L’Herbier national de Paris : une approche industrielle et automatisée Les enjeux Notes de bas de page Auteurs

    La reconfiguration du travail scientifique en biodiversité

    Ce livre est recensé par

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    Table des matières

    Chapitre 10. La numérisation des collections naturalistes

    Lorna Heaton, Patrícia Dias da Silva et Serge Proulx

    p. 159-177

    Texte intégral Les approches différenciées L’Herbier Marie-Victorin : une approche artisanale La Global Plants Initiative : la sous-traitance et la standardisation L’Herbier national de Paris : une approche industrielle et automatisée Les enjeux L’invisibilité des traces locales du travail distribué La caractérisation du travail à l’ère de la production participative L’accessibilité des données contributives Notes de bas de page Auteurs

    Texte intégral

    1Beaucoup de conservateurs de collections naturalistes rêvent de numériser leur collection. Cela leur permettrait non seulement de conserver le patrimoine naturel, mais également de le rendre accessible. La conservation des collections naturalistes comporte plusieurs défis. Par exemple, une collection d’insectes qui ont différents degrés de fragilité, différentes formes et tailles est difficile à conserver. Par ailleurs, la matière biologique conservée peut se détériorer assez facilement. Les conservateurs se sentent alors parfois obligés de restreindre les consultations physiques ou de limiter les prêts de spécimens pour en minimiser la dégradation. De plus, les systèmes de classification peuvent varier considérablement d’une collection à l’autre, ce qui rend leur harmonisation difficile. Enfin, ces ensembles naturalistes sont souvent des compilations de collections. Constituées peu à peu sur des décennies, voire des siècles, elles font rarement l’objet d’un inventaire systématique.

    2Les objets naturalistes sont, en tant que données primaires, à la base de nombreuses recherches scientifiques. Ils sont particulièrement essentiels dans le cas des sciences systématiques, c’est-à-dire des sciences basées sur les taxonomies (Hine, 2008). L’évolution et la complexité des problématiques liées à l’environnement (telle celle des changements climatiques) forment un nouveau contexte dans lequel les collections naturalistes sont mobilisées de manières différentes, notamment pour la modélisation. Cette diversification des usages va de pair avec l’élargissement des publics.

    3Parallèlement, les avancées techniques dans l’imagerie et la numérisation1, ainsi que les capacités accrues de traitement de données massives ouvrent les collections à de nouveaux publics. De par le monde, plusieurs initiatives ont vu le jour afin de coordonner les efforts de numérisation. Par exemple, iDigBio (www.idigbio.org) est une ressource nationale pour la numérisation des collections de la biodiversité, financée par la National Science Foundation aux États-Unis. Cette initiative s’inscrit dans le cadre du plan américain de numérisation de toutes les collections biologiques du pays pour rendre accessibles les données et les images de millions de spécimens biologiques en format électronique. iDigBio offre un support concret aux efforts de numérisation (tels que des flux de travail suggérés et des ateliers de formation) et vise à assurer l’interopérabilité et l’intégration des données de divers projets de numérisation.

    4Les spécimens numérisés ont des avantages évidents : ils sont infiniment copiables et partageables, ne se détériorent pas, prennent peu de place et devraient durer dans le temps. Séparés de certaines de leurs caractéristiques matérielles, les spécimens numérisés peuvent se détacher des lieux de leur collection pour devenir accessibles partout et en tout temps. Les outils numériques de visualisation permettent aux chercheurs aussi bien d’agrandir des images que de les sauvegarder et de les comparer, avec un haut niveau de résolution technique. La consultation du spécimen physique n’est alors nécessaire que si l’on doit faire un prélèvement pour des analyses moléculaires. Enfin, l’examen et la comparaison en ligne des spécimens permettent de mettre en évidence les lacunes des connaissances actuelles.

    5Si la numérisation des collections permet de stabiliser et de garantir la pérennité des collections, elle représente également une occasion d’en augmenter la valeur. Les données et les métadonnées associées aux spécimens numérisés et agrégées peuvent faire l’objet de recherches et de traitements informatiques. Cela permet de faire des analyses dirigées par les données, de développer ou tester des modèles, ou encore de générer de nouvelles hypothèses ou questions de recherche. Bien avant que l’on ait pu imaginer la consultation massive d’images numérisées de spécimens en ligne, Lane (1996, p. 536) avait déjà souligné l’importance de cette valeur ajoutée :

    L’informatisation des données sur les étiquettes facilite l’accès à des rapports sur la distribution et l’écologie des espèces pour les utilisateurs potentiels ; cela ajoute de la valeur aux données. L’interconnexion des bases de données favorise la robustesse de l’information que les collections d’histoire naturelle peuvent fournir aux instances qui élaborent des politiques ; une appréciation de la robustesse des données mènera à son tour à une meilleure appréciation des collections desquelles ces données sont tirées2.

    Malgré ces avantages évidents, la numérisation des collections naturalistes soulève également des inquiétudes chez les gestionnaires des collections. La préoccupation décisive est de savoir si des budgets suffisants seront encore consacrés au maintien des collections physiques, dans la mesure où la consultation et la recherche s’appuieront dorénavant surtout sur les spécimens numérisés. En d’autres termes, continuera-t-on à investir dans les locaux, ou reléguera-t-on ces collections physiques dans des entrepôts éloignés et peu accessibles ?

    6Chaque collection naturaliste a ses particularités, et les types de collections varient grandement entre elles. Numériser une collection entomologique implique d’autres défis et considérations que la numérisation technique d’une collection de champignons, d’oiseaux ou de plantes. Cependant, la virtualisation des spécimens ouvre des possibilités et soulève des défis semblables pour l’ensemble des collections naturelles. Ce chapitre aborde ces enjeux en examinant la numérisation d’un type de collection : les herbiers. Nous décrivons différentes approches de la numérisation à partir de trois cas : l’Herbier Marie-Victorin (Montréal) ; la Global Plants Initiative (GPI) et l’Herbier national de Paris. Ces cas se différencient d’abord sur le plan du processus de numérisation et ensuite sur celui de la participation des acteurs impliqués (amateurs, institutions). Ils mettent également en lumière certaines différences en ce qui concerne les utilisations prévues des données (en lien avec l’initiateur et les finalités du projet et, par conséquent, avec le régime de propriété des données – domaine public et commercialisation). Cette description révèle plusieurs des enjeux soulevés par la numérisation des collections, quel que soit le type de spécimen. Nous discuterons de ces enjeux à la fin du chapitre.

    Les approches différenciées

    7Une planche d’herbier témoigne de l’existence d’une plante à un moment précis et dans un lieu donné. Si, comparativement à d’autres collections, les herbiers sont techniquement faciles à numériser (les planches sont plates, avec un format plus ou moins standardisé), maintenir une collection de plantes séchées demeure un défi de taille. Une série de dangers omniprésents guette ces espaces de collection (insectes, dégradation par la lumière, fragilité des matériaux végétaux séchés). De plus, beaucoup d’herbiers institutionnels sont constitués de collections personnelles ou de celles de plus petites institutions intégrées sur des décennies. L’Herbier Marie-Victorin, à Montréal, a par exemple récupéré les herbiers de plusieurs institutions lorsque celles-ci ont fermé leurs portes. L’herbier contient aussi de nombreuses collections léguées par des botanistes – comme l’herbier personnel du frère Marie-Victorin ou la collection Dansereau (voir le chapitre 2). La numérisation d’un herbier paraît alors comme une occasion en or pour réaliser un inventaire systématique de ce que recèlent les tablettes de spécimens et pour faire en sorte, ensuite, d’en favoriser l’accès.

    8Les nombreuses initiatives de numérisation en cours adoptent différents modèles, selon les ressources disponibles et les visées des projets. Pignal et Pérez (2013, p. 28-29) écrivent : « Deux philosophies s’affrontent : la numérisation d’objets choisis contre la numérisation industrielle de tous les objets d’une collection. La première est sans doute intellectuellement la plus satisfaisante ; elle est pratiquée d’ailleurs depuis des années dans énormément de collections. » Les approches artisanales tendent à privilégier le choix de spécimens particulièrement significatifs et la réalisation du travail en interne. Cette numérisation par projet se fait principalement à petite échelle. À l’opposé, la numérisation de masse est quant à elle rendue de plus en plus viable avec les avancées techniques3. L’initiative du National Museum of Natural History de la Smithsonian Institution4 (Rogers, 2016), ou celle du Muséum national d’Histoire naturelle en France (MNHN) (Pignal et Pérez, 2013 ; Le Bras et al., 2017) en sont des exemples. Sur ce continuum, on trouve plusieurs variantes, telles que la sous-traitance du travail pour la production d’une base de données privée (cas de la Global Plants Initiative – voir Heaton et Proulx, 2012 – décrit plus loin dans ce chapitre), ou la mobilisation du grand public pour identifier les images numérisées (cas du MNHN avec Les Herbonautes – voir le chapitre 11)5.

    9Quelle que soit l’approche adoptée, la production d’un fichier numérique à partir d’une planche d’herbier nécessite deux grandes opérations. Ces dernières peuvent se décliner en une série d’étapes dont l’ordre et la distribution du travail varient selon le contexte. D’un côté, il s’agit de repérer, de préparer et de photographier (numériser) les planches (voir la figure 10.1). De l’autre, il faut associer la planche à ses données et métadonnées6.

    10Avant de la photographier, on doit préparer ou restaurer la planche. Il faut vérifier ou ajuster les bandelettes ou la colle qui tiennent le spécimen dans le but de s’assurer que la plante est bien fixée à la feuille. Dans certains cas, on enlève le spécimen de sa feuille d’origine et on le remonte pour solidifier la planche ou pour rehausser le contraste. Avant la numérisation, les étiquettes d’origine sont aussi recollées sur la planche. On produit ainsi une version plus « propre » de la planche, optimisée pour la numérisation.

    FIGURE 10.1. Une planche d’herbier numérisée

    Source : Canadensys.net

    11Au moment de la numérisation, d’autres éléments de contenu sont ajoutés. Une échelle de calibrage des couleurs et une règle métrique font partie du fond du dispositif de la numérisation et paraîtront ainsi sur chaque image. Ces deux éléments sont propres au format numérique. La règle métrique offre un repère en cas de changement d’échelle (zoomage), alors que l’échelle de couleurs vise à pallier les variations dans l’affichage de couleurs d’un moniteur à l’autre. Enfin, chaque planche numérisée doit porter une indication de l’herbier institutionnel qui héberge la planche et un numéro identifiant unique. Cela permettra ainsi d’associer l’image à sa fiche de données.

    12L’autre composante du travail est l’association des données à la planche. Outre le spécimen, une planche d’herbier contient plusieurs informations, qui lui confèrent toute sa valeur. On y trouvera généralement un numéro d’identification, le nom latin du spécimen, la date et le lieu de la récolte, ainsi que le nom de la personne qui l’a récolté. D’autres informations peuvent être ajoutées, comme une indication à propos de l’habitat de la récolte, le nom de la personne qui a identifié la plante si ce n’est pas le récolteur, ou une série d’étiquettes qui témoignent des changements dans l’identification du spécimen. Pour chaque spécimen, on devra saisir, sur un formulaire, la description des informations contenues sur la planche. Il faut aussi enregistrer des métadonnées techniques associées au processus de numérisation pour chaque image : le numéro unique d’identifiant, la résolution de l’image, la date de création du fichier électronique et, habituellement, le nom de la personne qui a réalisé le travail.

    L’Herbier Marie-Victorin : une approche artisanale

    13L’Herbier Marie-Victorin a été établi en 1920 par le don de spécimens personnels appartenant au frère Marie-Victorin, une figure importante dans la botanique au Québec. Il contient maintenant plus de 600 000 spécimens de plantes vasculaires qui proviennent surtout du nord-est de l’Amérique du Nord. La collection possède également un nombre important de spécimens internationaux. Il s’agit d’un herbier important du point de vue de sa taille et de sa renommée. L’Herbier se trouve au sein du Centre sur la biodiversité de l’Université de Montréal qui héberge aussi Canadensys, un portail de collections dont le but est de rendre accessibles au plus grand nombre les informations contenues dans les collections biologiques canadiennes par l’intermédiaire des infrastructures numériques (voir le chapitre 14).

    14En 2014, un nouveau processus mobilisant la photographie des spécimens a été lancé dans le but d’accroître la vitesse de numérisation et la mise en ligne des spécimens. Ce travail de numérisation est très intensif en matière de ressources. L’Herbier a par conséquent recruté et formé un groupe de bénévoles7, pour la plupart des amateurs, chargé de réaliser la majorité des étapes liées à ce processus. Puisque ce projet ne compte que deux employés permanents (un conservateur et un coordonnateur des collections), les amateurs sont une source importante de main-d’œuvre, fournissant le travail équivalent à trois ou quatre employés à plein temps en 20148.

    15Le travail des amateurs consiste à photographier des milliers de spécimens de l’Herbier, à écrire une entrée de base de données pour chacun d’entre eux, et à associer les images à la base de données. Chaque planche est photographiée à tour de rôle. En général, les amateurs se spécialisent dans la réalisation d’une tâche spécifique, même s’ils en connaissent plusieurs. Ainsi, aucun bénévole n’est chargé de la réalisation de l’intégralité du processus de numérisation d’une même planche. Les employés de l’Herbier orientent et supervisent l’ensemble des opérations. Ils sont responsables de l’efficacité du processus ainsi que de la qualité du résultat. Finalement, les spécimens sont mis en ligne par l’équipe d’informaticiens de Canadensys (voir le chapitre 14).

    16La numérisation de la collection suit une logique « par projet » selon les priorités de l’Herbier. Le premier projet a été une collaboration entre l’Herbier, la Division de la gestion de documents et des archives et la Direction de bibliothèques de l’Université de Montréal afin de jumeler des documents iconographiques résultant des voyages du frère Marie-Victorin avec des spécimens récoltés pendant ses sorties d’herborisation9. Ce projet d’essai, comprenant environ 1200 spécimens, a été l’occasion d’affiner le processus. D’autres spécimens sont numérisés en réponse à des demandes externes. Ainsi, dans le contexte d’une demande de prêt de spécimens par un autre herbier ou de consultation par un organisme gouvernemental, les spécimens sont numérisés avant d’être expédiés ou, encore, les fichiers numérisés sont envoyés en remplacement des spécimens physiques, selon les besoins des demandeurs. En août 2017, près d’un tiers des spécimens de la collection avaient été numérisés (208 000), 137 000 d’entre eux étaient géoréférencés et 16 000 avaient été photographiés.

    17Une ambiance d’inclusion et d’entraide règne au sein de l’équipe de travail de l’Herbier Marie-Victorin. Bien que le processus puisse paraître modulaire, avec une série de tâches bien distinctes à exécuter, les équipes ont d’importantes discussions sur la manière d’optimiser la réalisation du travail. Les amateurs ont eu une grande influence sur l’organisation du processus de travail définitif, de même que sur l’arrangement physique de l’installation photographique. La vocation éducative, muséale et de recherche de l’Herbier participe à créer les conditions dans lesquelles la qualité du résultat et la capacité d’apprentissage sont valorisées. Les amateurs sentent qu’ils peuvent apporter leurs compétences spécifiques à ce projet de numérisation. Certains ont notamment mis en place des ressources pour faciliter le géoréférencement, en créant une page Web qui répertorie les outils les plus pertinents pour réaliser cette tâche. Les amateurs sont très consciencieux et ont à cœur de bien faire leur travail en se concentrant davantage sur la qualité de la numérisation que sur la quantité de spécimens numérisés. Un véritable sens de l’engagement pour la réalisation et l’aboutissement de cette entreprise commune est partagé par l’ensemble des bénévoles, ainsi que le personnel de l’Herbier et celui de Canadensys. L’ouverture des gestionnaires aux suggestions des amateurs permet une autonomie relative pour réaliser le travail tout en respectant le cadre institutionnel général, les protocoles établis à chaque étape de la numérisation et les guides préparés par les bénévoles pour aider à la standardisation du processus. Ainsi, les protocoles ont une certaine flexibilité, les guides et les formulaires associés à la base de données sont adaptés de manière dynamique aux besoins ressentis dans la pratique, tout en suivant les conventions de la botanique et les standards déterminés par les institutions internationales.

    18On l’a vu, les spécimens numérisés se retrouvent sur Canadensys, un portail donnant accès aux données de trois groupes d’organismes (plantes, insectes, champignons) et qui intègre les collections des institutions canadiennes, principalement des collections universitaires. Toutefois, la valeur ajoutée de Canadensys réside surtout dans le fait que ce portail s’insère dans des infrastructures scientifiques à l’échelle mondiale – dont le Système mondial d’informations sur la biodiversité (Global Biodiversity Information Facility – GBIF ; eBird, décrite dans le chapitre 8 de ce livre, envoie également ses données au GBIF). Avec la devise « accès libre et gratuit aux données de la biodiversité », le GBIF est une infrastructure de données ouverte et internationale, financée par différents gouvernements. Au sein de l’Herbier, nous avons constaté une adhésion collective (et aussi individuelle) au principe de l’ouverture des données. Cela repose sur un cadrage institutionnel et disciplinaire qui promeut l’accès ouvert aux données de recherche. Les chercheurs de l’Herbier et de Canadensys donnent le ton, et les bénévoles adoptent le même raisonnement. Les données que produisent les amateurs peuvent être recherchées, consultées, utilisées, corrigées ou complétées par des chercheurs ou d’autres individus, non seulement sur Canadensys, mais en outre sur d’autres plateformes. Ainsi, les amateurs se voient engagés, en tant que contributeurs, dans un projet sur le long terme qui a des retombées allant bien au-delà de la simple gestion d’une collection.

    La Global Plants Initiative : la sous-traitance et la standardisation

    19Inaugurée en 2004, et financée par la Fondation Andrew W. Mellon, la Global Plants Initiative (GPI) est le produit d’un travail distribué et fortement standardisé. Dans le but de construire une base de données d’envergure internationale, plus de 300 herbiers dans 70 pays ont été invités, avec le soutien financier nécessaire, à numériser les données des étiquettes et à produire des images à très haute résolution de leurs spécimens types10. Ces images sont complétées par des références, illustrations, notes de terrain, photos, etc. On peut consulter le tout sur le portail JSTOR Global Plants (http://plants.jstor.org/), une archive numérique accessible sur abonnement. En 2017, la base de données contenait près de trois millions d’objets numériques, essentiellement des spécimens (deux millions et demi).

    20La cohérence interne de la base de données de la GPI dépend du respect de protocoles standardisés pour la capture d’images et des conventions sur les formats de données et de métadonnées. La procédure et l’instrumentation permettent de garantir les résultats. Le rôle des herbiers individuels est d’utiliser le matériel fourni, et d’envoyer les fichiers vers un endroit centralisé. Tous les sites participant à la GPI reçoivent un manuel d’instruction de 75 pages et le même modèle de numériseur, le HerbScan. Cet appareil étant monté à l’envers, la numérisation se fait sans qu’il soit nécessaire de renverser les planches. Le manuel d’instruction détaille le protocole de préparation et de numérisation afin que chaque image numérisée corresponde au format établi et remplisse certains critères de qualité. Les membres de chaque site reçoivent également une formation au début de leur participation au projet. Pour autant qu’ils respectent à la fois le format d’exportation, la nomenclature des fichiers et la syntaxe des données et des métadonnées à fournir, les partenaires de la GPI peuvent mettre au point leurs propres manières de faire.

    21Heaton et Proulx (2012) ont décrit le travail de l’équipe de l’herbier de l’Université Montpellier 2 (UM2) réalisé dans le cadre du projet GPI, qui a numérisé environ 27 000 spécimens types entre 2004 et 201411. L’équipe de numérisation de l’UM2 se composait en 2011 de cinq personnes. Tous les membres de cette équipe avaient suivi des formations scientifiques en lien avec l’environnement, la biologie, l’écologie, les espaces naturels ou l’agronomie, et affirmaient avoir « une sensibilité botanique ». Seul un membre de l’équipe avait suivi une formation spécifique en botanique. La division du travail au sein de l’équipe s’organisait à travers certaines spécialisations durant les différentes étapes du travail. Ainsi, la « botaniste référente » faisait le repérage de types dans l’herbier et, occasionnellement, la restauration des planches. Deux autres personnes consacraient la plupart de leur temps à la numérisation des planches. Tous les membres de l’équipe étaient chargés d’entrer les métadonnées dans la base de données.

    22Comme dans le cas de l’Herbier Marie-Victorin, le travail était fait de manière artisanale, planche par planche. Deux dimensions toutefois distinguent les sites respectifs de l’UM2 et de l’Herbier Marie-Victorin. D’une part, les membres des équipes GPI encadrés à Montpellier 2 sont des employés, payés pour leur travail et à qui on peut demander des comptes. D’autre part, la distribution de leur travail sur des centaines de sites les oblige à suivre un protocole fort, ce qui a une incidence sur le contenu du travail. Le fait que les fichiers numérisés proviennent de diverses sources exige l’ajout de deux éléments pour permettre leur intégration dans la base de données globale : une bandelette spécifiant l’origine de l’herbier d’où provient la planche (au sein du répertoire de l’Université Montpellier 2) et un code-barres12 contenant l’identifiant unique du spécimen type au sein de la GPI. La nécessité de standardisation influe aussi sur le type et la quantité de données saisies. La GPI voudrait que les spécimens soient comparables entre eux, c’est-à-dire qu’ils aient tous les mêmes champs de données. Cela augmente nécessairement le grain des données. La gestionnaire du projet à l’UM2 explique :

    On saisit beaucoup plus de données parce que, quitte à saisir des données, on va saisir toutes les données qu’on a à disposition par rapport à ce type-là [même si à la Fondation Mellon, ils veulent quelque chose qui soit standardisé entre herbiers]. Ils veulent le minimum de métadonnées, enfin, de données propres. Donc, on envoie le minimum de données, point. Donc, ils veulent le collecteur, la date de collecte, la ville et le pays de collecte d’où provient le type, où est-ce qu’il est hébergé, dans quelle collection il est gardé. L’ensemble des données, c’est ça.

    Si le personnel des herbiers se montre préoccupé par des considérations scientifiques, la GPI se restreint à la gestion du projet. En effet, elle ne s’occupe pas de la validation du contenu, comme la justesse de l’identification du spécimen sur le plan scientifique. Chaque équipe de travail participant à la GPI a la responsabilité de vérifier la conformité du fichier des métadonnées, notamment en ce qui concerne le format, avant de procéder à tout envoi de lots (de 1000 à 1200 images, les données sur les spécimens et leurs métadonnées associées). La GPI fait toutefois un contrôle aléatoire de qualité sur 10 % des images. Les résultats de ce contrôle de qualité sont publiés sur une interface Web interne, et sont accessibles aux partenaires pour qu’ils puissent corriger leurs métadonnées. Le contenu validé est ensuite publié en ligne par l’intermédiaire de JSTOR.

    L’Herbier national de Paris : une approche industrielle et automatisée

    23Certains projets disposent de budgets suffisants pour entreprendre des initiatives d’envergure. Des stratégies industrielles visent la numérisation des collections dans leur ensemble plutôt que la sélection de collections ou de spécimens particuliers. Par exemple, le gouvernement français a financé la rénovation de l’Herbier de Paris et la numérisation de sa collection13.

    24Entre 2008 et 2012, l’Herbier national de Paris a été rénové de fond en comble : le bâtiment a été restauré et les spécimens ont été reclassés et déplacés dans un système de rayonnage mobile afin de répondre aux standards actuels de conservation. Les gestionnaires du Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN) ont profité de l’occasion pour restaurer près d’un million de planches, traiter des planches jusqu’alors non montées ou non classées (backlog) et entreprendre une importante opération de numérisation de la collection des plantes vasculaires (Le Bras et al., 2017). Tous les spécimens de l’Herbier ont été emballés et envoyés dans un entrepôt situé en banlieue parisienne où ils ont été pris en charge par une compagnie privée. L’installation de trois lignes de production à la chaîne de même que l’établissement de trois quarts de travail ont permis de photographier 18 000 spécimens par jour. La numérisation a été faite par des employés sans formation ou expérience en botanique, et on a traité les spécimens par lots, sans prêter attention aux particularités de chacun. Au terme de la numérisation, les spécimens ont été replacés dans de nouvelles chemises, réordonnés selon le système de classification APG III et emballés de nouveau avant d’être transportés à l’Herbier rénové14.

    25Les informations de base (numéro de catalogue, nom de la plante et région géographique) ont été saisies pour chaque spécimen qui ne disposait pas déjà d’un enregistrement complet. Les données et les images associées ont été ensuite téléchargées vers la base de données Sonnerat15. Au total, 5 400 000 spécimens de plantes vasculaires ont été numérisés et, pour plus de 90 % d’entre eux, une nouvelle entrée de données a été créée.

    26Le projet de numérisation de l’Herbier de Paris a produit un vaste nombre d’images, mais les informations associées sont minimes. Puisque les étiquettes sur les planches contiennent de nombreuses informations, la reconnaissance optique de caractères a été expérimentée. Toutefois, il a été très difficile de déchiffrer l’écriture cursive et vieillie des étiquettes, et les résultats n’ont pas été satisfaisants. Une approche participative (crowdsourcing) de la transcription d’information, en cours depuis la fin 2012, suscite de meilleurs espoirs. Dans Les Herbonautes (http://lesherbonautes.mnhn.fr/) (voir les chapitres 11 et 13), les contributeurs consultent les images des spécimens et consignent des informations sur les étiquettes sur une plateforme Web. L’organisation par projet ou « mission » du site et son caractère ludique encouragent la participation du grand public et des spécialistes. Ils contribuent à l’enrichissement en permanence des données encore non renseignées. La validation de données est semi-automatisée, et les mêmes données doivent être entrées par plusieurs contributeurs afin d’être confirmées. À la mi-2018, 3156 contributeurs de différents niveaux d’expertise avaient travaillé sur 271 000 spécimens.

    27Fort de la réussite de cette initiative, un consortium d’institutions a remporté un concours national d’infrastructure pour étendre la numérisation à d’autres disciplines et collections. Le programme e-Recolnat (2013-2019) (www.recolnat.org/fr/) vise à mettre à disposition des collections naturalistes et à fournir des outils collaboratifs et des espaces pour permettre à la communauté scientifique « d’exploiter efficacement les ressources contenues dans ces réservoirs de données, et surtout dans les domaines scientifiques autres que la systématique ».

    Les enjeux

    28Les descriptions précédentes relatives aux conditions concrètes dans lesquelles se réalise le travail de numérisation des herbiers soulèvent des enjeux de nature sociologique dépassant l’unique contexte de la botanique. Il nous a semblé intéressant d’explorer quelques-uns de ces enjeux qui concernent transversalement la valeur du travail dans le contexte d’un capitalisme informationnel. Nous aborderons successivement : l’invisibilité des traces locales du travail distribué ; la caractérisation du travail à l’ère du crowdsourcing ; l’accessibilité des données contributives.

    L’invisibilité des traces locales du travail distribué

    29À l’échelle d’une base transnationale de données, la signature des personnes ayant travaillé à numériser et à organiser les informations est quasi invisible. Les métadonnées gardent une trace de la personne qui a produit l’entrée, mais avant tout à des fins de traçabilité pour faciliter la solution de problèmes pouvant advenir16. Or, cette invisibilité apparaît nécessaire du fait du contexte numérique. On doit distinguer, d’une part, le contexte local de production et, d’autre part, ce qui est produit effectivement dans le cadre de la construction systématique d’une infrastructure informationnelle de données destinée à leur diffusion et à leur consultation à une échelle internationale. Dans le cas du projet de la Global Plants Initiative (GPI), le travail de production des données est distribué : les « petites mains », se trouvant géographiquement sur de multiples sites, numérisent et classent leurs spécimens types dans un format standard afin que le tout soit compatible et « interopérable » à une échelle transnationale. Les seules traces précises des sites d’origine qui restent sur les planches finales sont le logo institutionnel apposé sur la règle de mesure numérisée avec la planche, et la référence à la localisation de l’échantillon type en ce qui concerne les métadonnées (Heaton et Proulx, 2012). La transcription des étiquettes des spécimens de l’Herbier de Paris est encore plus distribuée, faisant appel au crowdsourcing international. Enfin, dans le cas de l’Herbier Marie-Victorin, dont les données se retrouveront sur le GBIF, on constate également l’invisibilisation accrue du travail des bénévoles. Le GBIF exige que chaque jeu de données publié inclue les métadonnées de l’institution et des auteurs à des fins de citation. Le premier jeu de données publié (avant l’introduction de la photographie) a été attribué au conservateur, au responsable de l’infrastructure technique (Canadensys) et au bénévole qui avait produit l’inventaire. Le deuxième jeu de données, résultat du nouveau processus de numérisation nécessitant un plus grand nombre de bénévoles, liste comme auteurs le conservateur, le responsable de l’infrastructure technique et le coordonnateur de la collection. La participation des bénévoles est ainsi invisible, même si, sur la scène locale, on est très soucieux de reconnaître l’apport de chaque bénévole.

    30L’invisibilité du cadre local de production des données s’arrime de façon contradictoire à la visibilité optimale des données transmises à l’échelle mondiale. Les gestionnaires d’une base de données cherchent à proposer un dispositif technique transparent et facile à consulter. On vise la mise en place d’une interface « sans couture » (seamlessness) qui, par définition, masque le travail intensif d’articulation en amont pour le rendre invisible aux yeux du consommateur. Le passage transparent et sans difficulté – idéalement, sans que l’utilisateur s’en rende compte – d’un mode d’activité (travail vivant de production) à un autre (accumulation numérique des résultats de ce travail vivant) constitue aujourd’hui le grand défi des concepteurs de dispositifs et d’interfaces. L’impératif de standardisation (homogénéisation de la fiche de présentation) invite à masquer les provenances diverses et multiples de ces données numérisées.

    La caractérisation du travail à l’ère de la production participative

    31La nécessité, pour les scientifiques des sciences humaines et sociales (SHS), de rendre compte des conditions sociales du travail engendré par le contexte de l’économie numérique est devenue une obligation morale et politique. Il s’opère en effet une nouvelle division sociale du travail à l’ère du crowdsourcing. D’un côté, les personnels gestionnaires des plateformes numériques, au nom d’un impératif de « participation », font en sorte que les clients ou les contributeurs sollicités constituent à leur insu la main-d’œuvre non salariée, voire non rémunérée (ou très faiblement rémunérée), directement responsable de la production de la valeur ajoutée par l’économie numérique. De l’autre côté, cette masse d’amateurs et de contributeurs disséminés, d’usagers transformés en « travailleurs indépendants », non salariés, peu rémunérés, sollicités en permanence par les plateformes numériques, participent à la constitution d’une nouvelle « classe » de travailleurs exploités d’une manière inédite.

    32Le retour en scène des problématiques du travail numérique (digital labor) ravive les débats sur les transformations des formes du travail à l’ère numérique (travail pair à pair – p2p –, crowdsourcing, ubérisation) et les formes nouvelles d’exploitation sociale qu’elles engendrent. Ces perspectives critiques permettent de relativiser les discours euphoriques sur la contribution décisive des fans, la passion des amateurs ou la participation directe des citoyens à la production scientifique. Il ne s’agit en aucun cas de dénigrer la contribution effective et significative des non-experts à l’économie numérique.

    33Au sein de la communauté des chercheurs, la définition même de l’expression « digital labor » ne fait pas consensus. Face à l’extrême hétérogénéité des pratiques associées à cette notion, des chercheurs dénoncent l’amalgame facile entre toutes ces pratiques. Certains, comme Sébastien Broca (2017), proposent ainsi de dissocier les notions de valeur et de travail, de manière à restreindre l’usage de la notion de travail « aux seules activités intentionnellement productives »17. Par contraste, d’après Antonio Casilli (cité dans Vörös, 2017), la notion de digital labor permet de penser ensemble ces différentes pratiques de « parasubordination technique ». Dans le cas du MNHN, le recours au crowdsourcing permet d’envisager l’étendue considérable des formes nouvelles de production de la valeur caractérisant le « travail » des utilisateurs des plateformes numériques. D’autres exemples, comme celui du projet de numérisation du Smithsonian, dans lequel la sous-traitance de la transcription des étiquettes est faite au Suriname, donnent à voir les effets de la division internationale du travail engendrée par le double mouvement de globalisation et de numérisation de l’économie : le travail de conception s’effectuant au nord et les tâches d’exécution se concentrant dans le sud de la planète (Casilli dans Vörs, 2017).

    L’accessibilité des données contributives

    34Pour ce qui est des données contributives (ou « ascendantes ») – c’est-à-dire les données produites par les utilisateurs par opposition aux données diffusées centralement par des organisations publiques ou privées –, la chercheure Valérie Peugeot (2017) établit la distinction entre « données en communs » (dont la finalité et le régime peuvent être rattachés aux communs) et « données sous régime d’exclusivité » (pour lesquelles les gestionnaires de plateformes ont obtenu des droits exclusifs d’exploitation). Cette distinction apparaît pertinente pour réfléchir à l’enjeu décisif que constitue l’accessibilité des données construites dans les trois cas analysés dans les pages précédentes.

    35Attardons-nous d’abord au cas de l’Herbier Marie-Victorin dont les spécimens numérisés sont mis en ligne sur la plateforme Canadensys (voir le chapitre 14). Il s’agit d’un site ouvert (open) dont la mission explicite est de rendre l’information sur la biodiversité accessible au plus grand nombre, gratuitement et dans les meilleures conditions de consultation. Avec l’appui de cette plateforme, les données de l’Herbier Marie-Victorin sont intégrées dans une base internationale plus large, le GBIF. Canadensys et le GBIF opèrent principalement sous une licence CC0, ainsi que sous CC-BY ou CC-BY-NC18. Dans le deuxième cas étudié, celui de la Global Plants Initiative (GPI), les données sont consultables sur le portail JSTOR Global Plants, une archive accessible aux chercheurs sur abonnement. Canadensys et JSTOR opèrent ainsi selon deux logiques opposées : dans le premier cas, nous sommes dans un régime de mise en commun des données contributives (aboutissant ultimement à la construction de « communs informationnels » destinés à l’extension gratuite de la sphère des savoirs partagés à une échelle mondiale) ; dans le deuxième cas, nous avons affaire à un régime d’exclusivité des droits de réutilisation des données contributives. Ces droits sont ici détenus par une organisation privée et lucrative qui récupère une partie de la valeur économique des données contributives. Dans le dernier cas étudié, celui de L’Herbier national de Paris géré par le Muséum national d’Histoire naturelle, la numérisation massive de la vaste collection semble s’inscrire dans un projet de redéfinition et d’ajustement de la mission de l’Herbier. Nous formulons l’hypothèse selon laquelle la reconfiguration de cette mission conduira le gouvernement français à promouvoir un régime de valorisation des données contributives qui les tiendra à l’abri de son exploitation pour un nombre restreint d’individus et d’institutions et qui ouvrira les possibilités de réutilisation au-delà des fins commerciales ou lucratives.

    ***

    36Si les nombreux projets de numérisation en cours partout dans le monde en sont un indice, la numérisation des spécimens semble être la voie de l’avenir pour les collections naturalistes. Les projets d’envergure (le Smithsonian numérise l’entièreté de ses collections ; le projet Europeana vise à centraliser les collections numérisées de tous les musées, librairies, galeries et archives européens) côtoient de petits projets réalisés avec peu de ressources. Peu importe l’échelle et l’approche employée, la numérisation entraîne des avantages évidents en matière de conservation et d’inventaire de spécimens. Elle permet aussi d’élargir l’accessibilité des collections et ouvre la porte à des utilisations variées des spécimens par des publics différents. Si l’agrégation, l’accessibilité et la délocalisation des spécimens permettent de générer une valeur ajoutée, la numérisation soulève également des enjeux sociaux concernant la valeur économique du travail et sa distribution dans le contexte de la production et de la circulation internationale de connaissances scientifiques.

    Notes de bas de page

    1La numérisation peut signifier simplement l’entrée des données sur les spécimens, mais en réalité elle intègre de plus en plus la composante visuelle. Nous utiliserons ce terme dans ce chapitre pour évoquer la production d’une image d’un spécimen accompagnée de ses données et de ses métadonnées.

    2« Computerisation of label data makes such reports on distribution and ecology of species more readily available to potential users ; they add value to the data. Interconnecting the databases brings robustness to the information that natural history collections can provide to policy-making bodies ; appreciation of robust data will lead in turn to appreciation of the collections from which those data were taken. »

    3Voir le numéro spécial de Zookeys sur la numérisation de masse publié par Blagoderov et Smith (2012).

    4Le système mis au point par le muséum du Smithsonian traite jusqu’à 3500 spécimens par jour. Un premier opérateur place, toutes les quatre à six secondes, un spécimen sur une courroie transporteuse. Un autre y appose un code-barres autocollant, et un troisième remet les spécimens dans leurs chemises à la fin du processus. La photographie y est complètement automatisée et la transcription des étiquettes est sous-traitée à une compagnie au Suriname.

    5Certains projets peuvent aussi combiner des éléments des différentes approches. Ce chevauchement rend difficile toute classification dans l’absolu. Ainsi, certains des spécimens de l’Herbier Marie-Victorin, dont la numérisation artisanale et à petite échelle est décrite plus tard dans ce chapitre, font maintenant l’objet d’une transcription de style crowdsourcing dans le projet Les Herbonautes.

    6Les métadonnées sont littéralement les données sur les données, c’est-à-dire les informations décrivant les conditions de production des données (par exemple, le nom du chercheur, la date, etc.).

    7Les amateurs travaillant au sein de ce projet de l’Herbier utilisent le mot « bénévole » pour se désigner.

    8Pour une description approfondie, voir Heaton et Dias da Silva (2017).

    9Le résultat de cette collaboration s’appelle « Récolter pour la science » et peut être consulté en ligne : http://calypso.bib.umontreal.ca/cdm4/recolter_science_archives.php?CISOROOT=/_archives.

    10En botanique, certains spécimens revêtent une importance particulière. Ainsi, un « type » n’est pas « typique », mais le spécimen de référence qui a servi à identifier une espèce pour la première fois.

    11À partir de 2005, la numérisation a été coordonnée en partenariat par l’UM2 et Tela Botanica (voir le chapitre 7). Tela Botanica en a repris seul la responsabilité en 2011.

    12Le code-barres permet d’associer l’image numérisée à ses données et métadonnées. Selon les conventions établies, l’identifiant unique d’un spécimen type commence avec l’acronyme de l’herbier (dans ce cas : « MPU »), suivi du code de la collection et son numéro d’identifiant unique. Le code complet comporte toujours neuf caractères.

    13Sur le coût total du projet de 24,5 millions d’euros, la moitié environ était destinée à la rénovation du bâtiment et le reste à la gestion et à la numérisation des spécimens (Chagnoux et Pignal, 2014).

    14Une vidéo, coproduite par le Muséum, montre bien l’ampleur et le caractère industriel du projet : http://www.universcience.tv/video-herbier-26-18-000-planchesnumerisees-par-jour-5928.html

    15La base de données relationnelle Sonnerat a été créée en 1993 pour l’Herbier de Paris. Cette base est maintenant le dépôt des autres herbiers du MNHN et des partenaires du projet e-Recolnat.

    16Par contraste, le nom du chercheur de spécimen apparaît sur la notule que l’on ajoute sur le type au moment de donner les références bibliographiques. Cette notule est numérisée avec l’échantillon. On peut interpréter cela comme un indicateur de la valeur scientifique attribuée au travail de recherche du type, comparativement au travail technique et pratique, faiblement reconnu, des « petites mains » rattaché à la numérisation.

    17Selon Broca, il est hors de question d’amalgamer le « travail du consommateur » (par exemple, celui de l’utilisateur d’une plateforme) et celui du chauffeur d’Uber, pour ne mentionner qu’un cas d’école.

    18Les licences fournies par Creative Commons visent à encadrer la propriété intellectuelle et proposent différents droits d’utilisation. La licence CC0 dédie l’œuvre au domaine public et permet de copier, de modifier, de distribuer et de représenter l’œuvre, même à des fins commerciales, sans en demander l’autorisation. La licence CC-BY permet toute utilisation, mais exige que l’on reconnaisse la source (l’attribution), alors que la licence CC-BY-NC interdit les utilisations commerciales (https://creativecommons.org).

    Auteurs

    • Lorna Heaton

      Professeure en communication à l’Université de Montréal. Ses recherches portent sur le travail collaboratif, l’innovation communautaire et les relations entre conception et utilisation dans le design et l’utilisation des technologies numériques.

    • Patrícia Dias da Silva

      Patrícia Dias da Silva a fait son stage postdoctoral au Département de communication de l’Université de Montréal, où ses recherches ont porté sur les enjeux politiques des médias numériques. Elle est actuellement responsable des communications à l’Union internationale de promotion de la santé et d’éducation pour la santé [UIPES].

    • Serge Proulx

      Professeur émérite en communication à l’Université du Québec à Montréal et professeur associé à Télécom ParisTech. Ses recherches portent sur les mutations des usages et des dispositifs d’information et de communication, en particulier dans le contexte de l’économie numérique.

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    Table des matières

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    Chapitre 9. La qualité des données d’observation : entretien avec Maxim Larrivée de eButterfly

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    1La numérisation peut signifier simplement l’entrée des données sur les spécimens, mais en réalité elle intègre de plus en plus la composante visuelle. Nous utiliserons ce terme dans ce chapitre pour évoquer la production d’une image d’un spécimen accompagnée de ses données et de ses métadonnées.

    2« Computerisation of label data makes such reports on distribution and ecology of species more readily available to potential users ; they add value to the data. Interconnecting the databases brings robustness to the information that natural history collections can provide to policy-making bodies ; appreciation of robust data will lead in turn to appreciation of the collections from which those data were taken. »

    3Voir le numéro spécial de Zookeys sur la numérisation de masse publié par Blagoderov et Smith (2012).

    4Le système mis au point par le muséum du Smithsonian traite jusqu’à 3500 spécimens par jour. Un premier opérateur place, toutes les quatre à six secondes, un spécimen sur une courroie transporteuse. Un autre y appose un code-barres autocollant, et un troisième remet les spécimens dans leurs chemises à la fin du processus. La photographie y est complètement automatisée et la transcription des étiquettes est sous-traitée à une compagnie au Suriname.

    5Certains projets peuvent aussi combiner des éléments des différentes approches. Ce chevauchement rend difficile toute classification dans l’absolu. Ainsi, certains des spécimens de l’Herbier Marie-Victorin, dont la numérisation artisanale et à petite échelle est décrite plus tard dans ce chapitre, font maintenant l’objet d’une transcription de style crowdsourcing dans le projet Les Herbonautes.

    6Les métadonnées sont littéralement les données sur les données, c’est-à-dire les informations décrivant les conditions de production des données (par exemple, le nom du chercheur, la date, etc.).

    7Les amateurs travaillant au sein de ce projet de l’Herbier utilisent le mot « bénévole » pour se désigner.

    8Pour une description approfondie, voir Heaton et Dias da Silva (2017).

    9Le résultat de cette collaboration s’appelle « Récolter pour la science » et peut être consulté en ligne : http://calypso.bib.umontreal.ca/cdm4/recolter_science_archives.php?CISOROOT=/_archives.

    10En botanique, certains spécimens revêtent une importance particulière. Ainsi, un « type » n’est pas « typique », mais le spécimen de référence qui a servi à identifier une espèce pour la première fois.

    11À partir de 2005, la numérisation a été coordonnée en partenariat par l’UM2 et Tela Botanica (voir le chapitre 7). Tela Botanica en a repris seul la responsabilité en 2011.

    12Le code-barres permet d’associer l’image numérisée à ses données et métadonnées. Selon les conventions établies, l’identifiant unique d’un spécimen type commence avec l’acronyme de l’herbier (dans ce cas : « MPU »), suivi du code de la collection et son numéro d’identifiant unique. Le code complet comporte toujours neuf caractères.

    13Sur le coût total du projet de 24,5 millions d’euros, la moitié environ était destinée à la rénovation du bâtiment et le reste à la gestion et à la numérisation des spécimens (Chagnoux et Pignal, 2014).

    14Une vidéo, coproduite par le Muséum, montre bien l’ampleur et le caractère industriel du projet : http://www.universcience.tv/video-herbier-26-18-000-planchesnumerisees-par-jour-5928.html

    15La base de données relationnelle Sonnerat a été créée en 1993 pour l’Herbier de Paris. Cette base est maintenant le dépôt des autres herbiers du MNHN et des partenaires du projet e-Recolnat.

    16Par contraste, le nom du chercheur de spécimen apparaît sur la notule que l’on ajoute sur le type au moment de donner les références bibliographiques. Cette notule est numérisée avec l’échantillon. On peut interpréter cela comme un indicateur de la valeur scientifique attribuée au travail de recherche du type, comparativement au travail technique et pratique, faiblement reconnu, des « petites mains » rattaché à la numérisation.

    17Selon Broca, il est hors de question d’amalgamer le « travail du consommateur » (par exemple, celui de l’utilisateur d’une plateforme) et celui du chauffeur d’Uber, pour ne mentionner qu’un cas d’école.

    18Les licences fournies par Creative Commons visent à encadrer la propriété intellectuelle et proposent différents droits d’utilisation. La licence CC0 dédie l’œuvre au domaine public et permet de copier, de modifier, de distribuer et de représenter l’œuvre, même à des fins commerciales, sans en demander l’autorisation. La licence CC-BY permet toute utilisation, mais exige que l’on reconnaisse la source (l’attribution), alors que la licence CC-BY-NC interdit les utilisations commerciales (https://creativecommons.org).

    La reconfiguration du travail scientifique en biodiversité

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    Heaton, L., Silva, P. D. da, & Proulx, S. (2018). Chapitre 10. La numérisation des collections naturalistes. In L. Heaton, F. Millerand, P. Dias da Silva, & S. Proulx (éds.), La reconfiguration du travail scientifique en biodiversité. Montréal: Presses de l’Université de Montréal. https://doi.org/10.4000/14iz5
    Heaton, Lorna, Patrícia Dias da Silva, et Serge Proulx. « Chapitre 10. La numérisation des collections naturalistes ». In La reconfiguration du travail scientifique en biodiversité, édité par Lorna Heaton, Florence Millerand, Patricia Dias da Silva, et Serge Proulx. Montréal: Presses de l’Université de Montréal, 2018. doi:10.4000/14iz5.
    Heaton, Lorna, et al. « Chapitre 10. La numérisation des collections naturalistes ». La reconfiguration du travail scientifique en biodiversité, édité par Lorna Heaton et al., Presses de l’Université de Montréal, 2018, https://doi.org/10.4000/14iz5.

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    Heaton, L., Millerand, F., Dias da Silva, P., & Proulx, S. (éds.). (2018). La reconfiguration du travail scientifique en biodiversité. Montréal: Presses de l’Université de Montréal. https://doi.org/10.4000/14j3q
    Heaton, Lorna, Florence Millerand, Patricia Dias da Silva, et Serge Proulx, éd. La reconfiguration du travail scientifique en biodiversité. Montréal: Presses de l’Université de Montréal, 2018. doi:10.4000/14j3q.
    Heaton, Lorna, et al., éditeurs. La reconfiguration du travail scientifique en biodiversité. Presses de l’Université de Montréal, 2018, https://doi.org/10.4000/14j3q.
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