Annexes Partie III - Biodiversité et fonctionnement écologique

p. 339-348


Texte intégral

Annexe 1 – Listes des organismes rencontrés dans l’estuaire de la Gironde, par groupe taxonomique ou écologique

Poissons

1Liste des 88 espèces de poissons (agnathes compris) capturées dans l’estuaire de la Gironde entre 2006 et 2016. Guildes écologiques : FW dulcicole, DIA migrateur amphihalin, ER résident estuarien, MS espèce marine saisonnière, MA espèce marine occasionnelle, MJ espèce marine juvénile. Guildes de position : D démersal, B benthique, P pélagique. Guildes trophiques : IB prédateur d’invertébrés benthiques, Z zooplanctonophage, O omnivore, IS prédateur d’invertébrés supra-benthiques, F piscivore, Par parasite. Zone de présence : D Dordogne, Gam Garonne amont, Gav Garonne aval, GAM Gironde amont, GAV Gironde aval (encart, p. 142).

Espèce

Nom vernaculaire

Guilde écologique

Guilde de position

Guilde trophique

Zone de présence

Abramis brama

Brème d’eau douce

FW

D

IB

GAM, Gam, D

Acipenser sturio

Esturgeon commun

DIA

D

IB

GAV, GAM, D

Agonus cataphractus

Souris de mer

ER

B

IB

GAV

Alburnus alburnus

Ablette

FW

P

Z

Gam, D

Alosa alosa

Alose vraie

DIA

P

Z

GAV, GAM

Alosa fallax

Alose feinte

DIA

P

Z

GAV, GAM, Gam, D

Ameiurus melas

Poisson chat

FW

D

O

GAM

Ammodytes tobianus

Equille

ER

B

Z

GAV

Anguilla anguilla

Anguille d’Europe

DIA

D

O

GAV, GAM, Gav, Gam, D

Aphia minuta

Nonnat

ER

P

Z

GAV

Argyrosomus regius

Maigre commun

MS

D

IS

GAV, GAM

Arnoglossus thori

Arnoglosse tacheté

MA

B

IB

GAV

Atherina presbyter

Prêtre

ER

P

Z

GAV

Balistes capriscus

Baliste

MA

D

IS

GAV

Barbus barbus

Barbeau fluviatile

FW

D

IB

GAM, Gam, D

Blicca bjoerkna

Brème bordelière

FW

D

IB

Gam, D

Callionymus lyra

Callionyme lyre

ER

B

IB

GAV

Carassius carassius

Carassin commun

FW

D

O

GAM, Gam, D

Chelidonichthys lucernus

Grondin perlon

MJ

B

IS

GAV

Chelon auratus

Mulet doré

DIA

D

O

GAV

Chelon labrosus

Mulet lippu

DIA

D

O

GAV

Chelon ramada

Mulet porc

DIA

D

O

GAV, GAM

Ciliata mustela

Motelle à cinq barbillons

ER

B

O

GAV

Clupea harengus

Hareng de l’Atlantique

MJ

P

Z

GAV

Conger conger

Congre d’Europe

MA

D

F

GAV

Cyprinus carpio

Carpe commune

FW

D

O

GAM, Gav, Gam, D

Dasyatis pastinaca

Pastenague

GAV

Dicentrarchus labrax

Bar européen

MJ

D

IS

GAV, GAM, Gav, Gam, D

Dicentrarchus punctatus

Bar tacheté

MJ

D

IS

GAV

Dicologlossa cuneata

Céteau

MA

B

IB

GAV

Diplodus vulgaris

Sar commun

MJ

D

IS

GAV

Echiichthys vipera

Petite vive

MA

B

IS

GAV

Engraulis encrasicolus

Anchois

MS

P

Z

GAV, GAM, Gav

Gadus morhua

Morue

GAV

Gasterosteus aculeatus

Epinoche à trois épines

ER

D

IB

GAV, GAM, Gav, Gam, D

Gobius niger

Gobie noir

ER

B

IB

GAV

Gobius paganellus

Gobie paganel

ER

B

IB

GAV

Hippocampus hippocampus

Hippocampe à museau court

ER

B

Z

GAV

Hyperoplus lanceolatus

Lançon commun

MA

D

Z

GAV

Labrus bergylta

Vieille commune

MA

D

IB

GAV

Lampetra fluviatilis

Lamproie fluviatile

DIA

P

Par

GAM

Lepomis gibbosus

Perche soleil

FW

D

IS

Gam

Leucaspius delineatus

Able de Heckel

FW

P

Z

Gam

Lithognathus mormyrus

Marbré

MJ

D

IS

GAV

Merlangius merlangus

Merlan

MJ

D

IS

GAV

Merluccius merluccius

Merlu européen

MA

D

F

GAV

Micromesistius poutassou

Merlan bleu

GAV

Mullus barbatus barbatus

Rouget de vase

MA

B

IB

GAV

Mullus surmuletus

Rouget de roche

MJ

B

IB

GAV

Pegusa lascaris

Sole-pole

MA

B

IB

GAV

Petromyzon marinus

Lamproie marine

DIA

P

Par

GAV, GAM

Platichthys flesus

Flet d’Europe

DIA

B

IB

GAV, GAM, Gav, Gam, D

Pleuronectes platessa

Plie d’Europe

MJ

B

IB

GAV

Pollachius pollachius

Lieu jaune

MJ

D

F

GAV

Pomatoschistus microps

Gobie tacheté

ER

B

IB

GAM, Gav, Gam, D

Pomatoschistus minutus

Gobie buhotte

ER

B

IB

GAV, GAM, Gav, D

Pomatoschistus pictus

Gobie varié

ER

B

IB

GAV

Psetta maxima

Turbot

MJ

B

IB

GAV

Pseudorasbora parva

Pseudorasbora

FW

P

O

GAM, Gav

Raja clavata

Raie bouclée

MA

B

IB

GAV

Raja microocellata

Raie ocellée

GAV

Raja undulata

Raie brunette

MA

B

IB

GAV

Rutilus rutilus

Gardon

FW

P

O

Gav, D

Salmo salar

Saumon de l’Atlantique

DIA

P

IS

GAM, GAV

Sander lucioperca

Sandre

FW

D

F

GAM, Gav, Gam

Sardina pilchardus

Sardine commune

MJ

P

Z

GAV

Scardinius erythrophthalmus

Rotengle

FW

P

O

Gam

Scomber scombrus

Maquereau

MA

P

IS

GAV

Scophthalmus rhombus

Barbue

MJ

B

IB

GAV

Silurus glanis

Silure glane

FW

D

F

GAM, Gam, D

Solea senegalensis

Sole sénégalaise

MJ

B

IB

GAV, GAM

Solea solea

Sole commune

MJ

B

IB

GAV, GAM

Sparus aurata

Dorade royale

MA

D

IS

GAV

Spondyliosoma cantharus

Griset

MJ

D

IS

GAV

Sprattus sprattus

Sprat

MJ

P

Z

GAV, GAM

Squalius cephalus

Chevaine

FW

P

O

Gam, D

Symphodus bailloni

Crénilabre grelue

ER

D

O

GAV

Symphodus roissali

Crénilabre langaneu

ER

D

IS

GAV

Syngnathus acus

Syngnathe aiguille

ER

D

Z

GAV

Syngnathus rostellatus

Syngnathe de Duméril

ER

P

Z

GAV, GAM

Taurulus bubalis

Chabot buffle

MA

B

O

GAM

Torpedo marmorata

Torpille marbrée

MA

B

IB

GAV

Trachurus trachurus

Chinchard d’Europe

MJ

P

F

GAV

Trisopterus luscus

Tacaud commun

MJ

D

IS

GAV

Trisopterus minutus

Capelan

MA

D

IS

GAV

Umbrina canariensis

Ombrine bronze

MA

D

IS

GAV

Umbrina cirrosa

Ombrine du large

MA

D

IS

GAV

Uranoscopus scaber

Uranoscope

MA

B

IS

GAV

2D’après les données de la littérature.

3NB : les espèces généralement associées à des substrats durs sont signalées par un *.

Cnidaires

  • *Actinia equina (Linnaeus, 1758)

  • *Actinia fragacea Tugwell, 1856

  • *Anemonia viridis (Forsskål, 1775)

  • *Diadumene cincta Stephenson, 1925

  • *Dynamena pumila (Linnaeus, 1758)

  • *Ectopleura larynx (Ellis & Solander, 1786)

  • *Laomedea flexuosa Alder, 1857

  • *Nemertesia antennina (Linnaeus, 1758)

Némertes

  • Tubulanus polymorphus Renier, 1804

Annélides Oligochètes

  • Branchiura sowerbyi Beddard, 1892

  • Limnodrilus hoffmeisteri Claparède, 1862

  • Nais elinguis Müller, 1774

  • Tubifex tubifex (Müller, 1774)

  • Tubificoides benedii (d’Udekem, 1855)

  • Tubificoides brownae Brinkhurst & Baker, 1979

  • Tubificoides heterochaetus (Michaelsen, 1926)

  • Tubificoides pseudogaster (Dahl, 1960)

Annélides Polychètes

  • Alitta succinea (Leuckart, 1847)

  • Alkmaria romijni Horst, 1919

  • Aonides oxycephala (Sars, 1862)

  • Aphelochaeta marioni (Saint Joseph, 1894)

  • Arenicola marina (Linnaeus, 1758)

  • Boccardiella ligerica (Ferronnière, 1898)

  • Capitella capitata (Fabricius, 1780)

  • Caulleriella bioculata (Keferstein, 1862)

  • Chaetozone zetlandica McIntosh, 1911

  • Cossura pygodactylata Jones, 1956

  • Diopatra biscayensis Fauchald, Berke & Woodin, 2012

  • Eulalia viridis (Linnaeus, 1767)

  • Glycera tridactyla Schmarda, 1861

  • Goniada sp.

  • Hediste diversicolor (O.F. Müller, 1776)

  • Heteromastus filiformis (Claparède, 1864)

  • Lagis koreni Malmgren, 1866

  • Lanice conchilega (Pallas, 1766)

  • Lysidice unicornis (Grube, 1840)

  • Magelona mirabilis (Johnston, 1865)

  • Malacoceros fuliginosus (Claparède, 1870)

  • Manayunkia aestuarina (Bourne, 1883)

  • Mysta picta (Quatrefages, 1866)

  • Nephtys caeca (Fabricius, 1780) ?

  • Nephtys cirrosa Ehlers, 1868

  • Nephtys hombergii Savigny in Lamarck, 1818

  • Nephtys longosetosa Oersted, 1842

  • Nereis rava Ehlers, 1868

  • Notomastus latericeus Sars, 1851

  • Ophelia neglecta Schneider, 1892

  • Paradoneis armata Glémarec, 1966 ?

  • Poecilochaetus serpens Allen, 1904

  • Polydora cornuta Bosc, 1802

  • Pseudopolydora pulchra (Carazzi, 1893)

  • Pygospio elegans Claparède, 1863

  • *Sabellaria alveolata (Linnaeus, 1767)

  • Scolelepis foliosa (Audouin & Milne Edwards, 1833)

  • Scolelepis squamata (O.F. Müller, 1806)

  • Streblospio shrubsolii (Buchanan, 1890)

  • Travisia forbesii Johnston, 1840

Mollusques Polyplacophores

  • *Acanthochitona fascicularis (Linnaeus, 1767)

  • *Lepidochitona cinerea (Linnaeus, 1767)

Mollusques Bivalves

  • Abra alba (W. Wood, 1802)

  • Abra segmentum (Récluz, 1843)

  • Abra tenuis (Montagu, 1803)

  • Acanthocardia aculeata (Linnaeus, 1758)

  • *Barnea candida (Linnaeus, 1758)

  • *Barnea parva (Pennant, 1777)

  • Callista chione (Linnaeus, 1758)

  • Cerastoderma edule (Linnaeus, 1758)

  • Corbicula fluminea (O.F. Müller, 1774)

  • Donax semistriatus Poli, 1795

  • Gastrana fragilis (Linnaeus, 1758)

  • Hiatella rugosa (Linnaeus, 1767)

  • Kurtiella bidentata (Montagu, 1803)

  • Limecola balthica (Linnaeus, 1758)

  • Lutraria lutraria (Linnaeus, 1758)

  • *Lyrodus pedicellatus (Quatrefages, 1849)

  • Macomangulus tenuis (da Costa, 1778)

  • Mactra stultorum (Linnaeus, 1758)

  • *Magallana angulata (Lamarck, 1819)

  • *Magallana gigas (Thunberg, 1793)

  • *Mimachlamys varia (Linnaeus, 1758)

  • *Modiolus barbatus (Linnaeus, 1758)

  • *Modiolus modiolus (Linnaeus, 1758)

  • Mya arenaria Linnaeus, 1758

  • *Mytilus edulis Linnaeus, 1758

  • *Mytilus galloprovincialis Lamarck, 1819

  • *Nototeredo norvagica (Spengler, 1792)

  • *Ostrea edulis Linnaeus, 1758

  • Parvicardium exiguum (Gmelin, 1791)

  • *Petricola lithophaga (Retzius, 1788)

  • *Pholas dactylus Linnaeus, 1758

  • Ruditapes decussatus (Linnaeus, 1758)

  • Ruditapes philippinarum (Adams & Reeve, 1850)

  • Scrobicularia plana (da Costa, 1778)

  • Solen marginatus Pulteney, 1799

  • Spisula solida (Linnaeus, 1758)

  • Spisula subtruncata (da Costa, 1778)

  • Striarca lactea (Linnaeus, 1758)

  • Venerupis corrugata (Gmelin, 1791)

Mollusques Gastéropodes

  • Acteon tornatilis (Linnaeus, 1758)

  • Aplysia fasciata Poiret, 1789

  • Assiminea eliae Paladilhe, 1875 ?

  • Assiminea grayana J. Fleming, 1828

  • Bittium reticulatum (da Costa, 1778)

  • Brachystomia eulimoides (Hanley, 1844)

  • Colus jeffreysianus (P. Fischer, 1868)

  • *Crepidula fornicata (Linnaeus, 1758)

  • Doris verrucosa Linnaeus, 1758

  • Euspira catena (da Costa, 1778)

  • *Haliotis tuberculata Linnaeus, 1758

  • Haminoea navicula (da Costa, 1778)

  • Hydrobia acuta (Draparnaud, 1805)

  • Janthina janthina (Linnaeus, 1758)

  • Limapontia depressa Alder & Hancock, 1862

  • Littorina littorea (Linnaeus, 1758)

  • *Littorina obtusata (Linnaeus, 1758)

  • Littorina saxatilis (Olivi, 1792)

  • Megastomia conoidea (Brocchi, 1814)

  • *Melarhaphe neritoides (Linnaeus, 1758)

  • Myosotella denticulata (Montagu, 1803)

  • Myosotella myosotis (Draparnaud, 1801)

  • *Nucella lapillus (Linnaeus, 1758)

  • *Ocenebra erinaceus (Linnaeus, 1758)

  • *Patella depressa Pennant, 1777

  • *Patella pellucida Linnaeus, 1758

  • *Patella ulyssiponensis Gmelin, 1791

  • *Patella vulgata Linnaeus, 1758

  • Peringia microstoma Bourguignat, 1876 ?

  • Peringia obesa Mabille, 1877 ?

  • Peringia perieriana Bourguignat, 1876 ?

  • Peringia ulvae (Pennant, 1777)

  • Philine aperta (Linnaeus, 1767)

  • *Phorcus lineatus (da Costa, 1778)

  • Potamopyrgus antipodarum (Gray, 1843)

  • Retusa obtusa (Montagu, 1803)

  • Rissoa parva (da Costa, 1778)

  • Steromphala umbilicalis (da Costa, 1778)

  • Tritia incrassata (Ström, 1768)

  • Tritia reticulata (Linnaeus, 1758)

  • Trivia monacha (da Costa, 1778)

  • Truncatella subcylindrica (Linnaeus, 1767)

Mollusques Scaphopodes

  • Antalis vulgaris (da Costa, 1778)

Mollusques Céphalopodes

  • Sepiola atlantica d’Orbigny [in Férussac & d’Orbigny], 1839-1842

Pycnogonides

  • Callipallene brevirostris (Johnston, 1837)

Crustacés Cirripèdes

4*Amphibalanus improvisus (Darwin, 1854)

5*Austrominius modestus (Darwin, 1854)

6*Balanus crenatus Bruguière, 1789

7*Chthamalus montagui Southward, 1976

8*Chthamalus stellatus (Poli, 1791)

9*Perforatus perforatus (Bruguière, 1789)

10*Semibalanus balanoides (Linnaeus, 1767)

Crustacés Mysidacés

  • Gastrosaccus roscoffensis Bacescu, 1970

  • Gastrosaccus sanctus (Van Beneden, 1861)

  • Gastrosaccus spinifer (Goës, 1864)

  • Leptomysis lingvura (G.O. Sars, 1866)

  • Mesopodopsis slabberi (Van Beneden, 1861)

  • Neomysis integer (Leach, 1814)

  • Praunus flexuosus (Müller, 1776)

  • Praunus neglectus (G.O. Sars, 1869)

  • Schistomysis kervillei (G.O. Sars, 1885)

  • Schistomysis spiritus (Norman, 1860)

Crustacés Cumacés

  • Cumopsis longipes (Dohrn, 1869)

  • Iphinoe trispinosa (Goodsir, 1843)

Crustacés Tanaïdacés

  • Apseudopsis latreillii (Milne Edwards, 1828)

Crustacés Amphipodes

  • Ampithoe valida Smith, 1873

  • Apocorophium acutum (Chevreux, 1908)

  • Apohyale prevostii (H. Milne Edwards, 1830)

  • Bathyporeia nana Toulmond, 1966

  • Bathyporeia pelagica (Spence Bate, 1856)

  • Bathyporeia pilosa Lindström, 1855

  • Bathyporeia sarsi Watkin, 1938

  • Britorchestia brito (Stebbing, 1891)

  • Caprella equilibra Say, 1818

  • Caprella penantis Leach, 1814

  • Corophium volutator (Pallas, 1766)

  • Cressa dubia (Spence Bate, 1857)

  • Echinogammarus marinus (Leach, 1815)

  • Gammaropsis maculata (Johnston, 1828)

  • Gammarus crinicornis Stock, 1966

  • Gammarus duebeni Lilljeborg, 1852

  • Gammarus insensibilis Stock, 1966

  • Gammarus salinus Spooner, 1947

  • Gammarus zaddachi Sexton, 1912

  • Haustorius arenarius (Slabber, 1769)

  • Hyale pontica Rathke, 1847

  • Hyale stebbingi Chevreux, 1888

  • Incisocalliope aestuarius (Watling & Maurer, 1973)

  • Leucothoe lilljeborgi Boeck, 1861

  • Melita nitida Smith, 1873

  • Melita palmata (Montagu, 1804)

  • Microprotopus maculatus Norman, 1867

  • Monocorophium acherusicum (Costa, 1853)

  • Nototropis guttatus Costa, 1853

  • Nototropis swammerdamei (H. Milne Edwards, 1830)

  • Pariambus typicus (Kröyer, 1844)

  • Phtisica marina Slabber, 1769

  • Pontocrates arenarius (Spence Bate, 1858)

  • Synchelidium haplocheles (Grube, 1864)

  • Urothoe pulchella (Costa, 1853)

Crustacés Isopodes

  • Anilocra physodes (Linnaeus, 1758)

  • Cirolana cranchi Leach, 1818

  • Cyathura carinata (Krøyer, 1847)

  • Eurydice affinis Hansen, 1905

  • Eurydice pulchra Leach, 1815

  • Eurydice cf. spinigera Hansen, 1890

  • Hemioniscus balani Buchholz, 1866

  • Idotea emarginata (Fabricius, 1793)

  • *Idotea granulosa Rathke, 1843

  • Idotea linearis (Linnaeus, 1766)

  • *Idotea pelagica Leach, 1816

  • Jaera praehirsuta Forsman, 1949

  • Lekanesphaera rugicauda (Leach, 1814)

  • Sphaeroma serratum (Fabricius, 1787)

  • Synidotea laticauda Benedict, 1897

Crustacés Euphausiacés

  • Nyctiphanes couchii (Bell, 1853)

Crustacés Décapodes

  • Anapagurus hyndmanni (Bell, 1846)

  • Atelecyclus undecimdentatus (Herbst, 1783)

  • Athanas nitescens (Leach, 1813 [in Leach, 1813-1814])

  • Atyaephyra desmarestii (Millet, 1831)

  • Calappa granulata (Linnaeus, 1758)

  • Callinectes sapidus Rathbun, 1896

  • *Cancer pagurus Linnaeus, 1758

  • Carcinus maenas (Linnaeus, 1758)

  • *Clibanarius erythropus (Latreille, 1818)

  • Crangon crangon (Linnaeus, 1758)

  • Eriocheir sinensis H. Milne Edwards, 1853

  • Eriphia verrucosa (Forskål, 1775)

  • Eualus cranchii (Leach, 1817 [in Leach, 1815-1875])

  • Galathea intermedia Lilljeborg, 1851

  • Galathea squamifera Leach, 1814

  • *Hemigrapsus takanoi Asakura & Watanabe, 2005

  • Inachus sp.

  • Liocarcinus depurator (Linnaeus, 1758)

  • Liocarcinus holsatus (Fabricius, 1798)

  • Macropodia rostrata (Linnaeus, 1761)

  • Maja brachydactyla Balss, 1922

  • Necora puber (Linnaeus, 1767)

  • *Pachygrapsus marmoratus (Fabricius, 1787)

  • Palaemon adspersus Rathke, 1837

  • Palaemon elegans Rathke, 1837

  • Palaemon longirostris H. Milne Edwards, 1837 [in H. Milne Edwards, 1834-1840]

  • Palaemon macrodactylus Rathbun, 1902

  • Palaemon serratus (Pennant, 1777)

  • Palaemon varians Leach, 1813 [in Leach, 1813-1814]

  • Pilumnus hirtellus (Linnaeus, 1761)

  • Pilumnus spinifer H. Milne Edwards, 1834

  • Pinnotheres pisum (Linnaeus, 1767)

  • Pisa tetraodon (Pennant, 1777)

  • Pisidia longicornis (Linnaeus, 1767)

  • Planes minutus (Linnaeus, 1758) ?

  • Polybius henslowii Leach, 1820

  • *Porcellana platycheles (Pennant, 1777)

  • Procambarus clarkii (Girard, 1852)

  • Processa edulis edulis (Risso, 1816)

  • Processa parva Holthuis, 1951

  • Rhithropanopeus harrisii (Gould, 1841)

  • Xantho hydrophilus (Herbst, 1790)

Bryozoaires

  • *Anguinella palmata Van Beneden, 1845

  • *Crisia eburnea (Linnaeus, 1758)

  • *Disporella hispida (Fleming, 1828)

  • *Microporella ciliata (Pallas, 1766)

  • *Plagioecia patina (Lamarck, 1816)

  • *Scruparia chelata (Linnaeus, 1758)

  • *Scrupocellaria scruposa (Linnaeus, 1758)

  • *Tubulipora liliacea (Pallas, 1766)

Echinodermes

  • Asterias rubens Linnaeus, 1758

  • Echinocardium mediterraneum (Forbes, 1844)

  • Ophiura ophiura (Linnaeus, 1758)

11D’après les données de la littérature.

Nématodes

  • Adoncholaimus thalassophygas (de Man, 1876) Filipjev, 1918

  • Aegialoalaimus elegans de Man, 1907

  • Anoplostoma viviparum (Bastian, 1865) Bütschli, 1874

  • Antomicron elegans (de Man, 1922) De Coninck, 1965

  • Axonolaimus paraspinosus Schuurmans Stekhoven & Adam, 1931

  • Axonolaimus spinosus (Bütschli, 1874)

  • Bathylaimus sp.

  • Calyptronema maxweberi (de Man, 1922) Wieser, 1953

  • Cervonema sp.

  • Chromadora macrolaima de Man, 1889

  • Chromadorida sp.

  • Chromadorina germanica (Bütschli, 1874) Wieser, 1954

  • Cyartonema germanicum Juario, 1972

  • Daptonema spp.

  • Daptonema cf. biggi (Gerlach, 1965) Lorenzen, 1977

  • Daptonema normandicum (de Man, 1890)

  • Daptonema oxycerca (de Man, 1888)

  • Daptonema setosum (Bütschli, 1874)

  • Daptonema xyaliforme (Wieser & Hopper, 1967)

  • Dichromadora cephalata (Steiner, 1916)

  • Dichromadora geophila de Man, 1876

  • Diplolaimella sp.

  • Halalaimus gracilis de Man, 1888

  • Halalaimus sp.

  • Innocuonema tentabunda (de Man, 1890) Inglis, 1969

  • Leptolaimus papilliger de Man, 1876

  • Leptolaimus sp.

  • Linhomoeidae sp.

  • Metachromadoroides remanei (Gerlach, 1951)

  • Metalinhomoeus aff. biformis Juario, 1974

  • Monhysteridae sp.

  • Oncholaimus sp.

  • Paramonohystera sp.

  • Pareudiplogaster pararmatus (Romeyn & Bouwman, 1983)

  • Praeacanthonchus punctatus (Bastian, 1865) Micoletzky, 1924

  • Pseudolella granulifera Cobb, 1920

  • Ptycholaimellus ponticus (Filipjev, 1922) Gerlach, 1955

  • Sabatieria pulchra (Schneider, 1906)

  • Sabatieria sp.

  • Sphaerolaimus gracilis de Man, 1876

  • Sphaerolaimus hirsutus Bastian, 1865

  • Syringolaimus sp.

  • Terschellingia communis de Man, 1888

  • Terschellingia longicaudata de Man, 1907

  • Theristus sp.

  • Tobrilus diversipapillatus (Daday, 1905)

  • Tripyloides gracilis (Ditlevsen, 1918) Filipjev, 1927

  • Viscosia viscosa (Bastian, 1865) de Man, 1890

Crustacés Ostracodes

  • Aurila convexa (Baird, 1850)

  • Candona sp.

  • Cushmanidea elongata (Brady, 1868) Puri, 1958

  • Cyprideis torosa (Jones, 1850)

  • Cyprinotus salinus (Brady, 1868)

  • Cytherois fischeri (Sars, 1866)

  • Heterocythereis albomaculata (Baird, 1838)

  • Ilyocypris gibba (Ramdohr, 1808)

  • Leptocythere castanea (Sars, 1866)

  • Loxoconcha elliptica Brady, 1868

  • Paradoxostoma sp.

  • Semicytherura sella (Sars, 1866)

  • Urocythereis oblonga (Brady, 1868) Wagner, 1957

  • Xestoleberis aurantia (Baird, 1838)

Crustacés Copépodes

  • Amphiascoides limicola (Brady, 1899)

  • Amphiascoides subdebilis (Willey, 1935)

  • Asellopsis intermedia (T. Scott, 1895)

  • Attheyella crassa (G.O. Sars, 1863)

  • Canuella perplexa T. & A. Scott, 1893

  • Delavalia palustris Brady, 1868

  • Ectinosoma melaniceps Boeck, 1865

  • Enhydrosoma caeni Raibaut, 1965

  • Enhydrosoma gariene Gurney, 1930

  • Enhydrosoma propinquum (Brady, 1880)

  • Halectinosoma curticorne (Boeck, 1873)

  • Halectinosoma sp.

  • Harpacticus littoralis G.O. Sars, 1910

  • Microarthridion fallax Perkins, 1956

  • Microarthridion littorale (Poppe, 1881)

  • Nannopus palustris Brady, 1880

  • Nitokra lacustris (Shmankevich, 1875)

  • Paraleptastacus sp.

  • Paronychocamptus nanus (G.O. Sars, 1908)

  • Platychelipus littoralis Brady, 1880

  • Pseudobradya minor T. & A. Scott, 1895

  • Psyllocamptus propinquus (T. Scott, 1895)

  • Schizopera cf. compacta Lint, 1922

  • Schizopera pratensis Noodt, 1958

  • Schizopera sp.

  • Strongylacron buchholtzi (Boeck, 1873)

  • Tachidius discipes Giesbrecht, 1881

12D’après les données de la littérature.

Appendiculaires

  • Oikopleura (Vexillaria) dioica Fol, 1872

Cnidaires

  • Blackfordia virginica Mayer, 1910

  • Liriope tetraphylla (Chamisso & Eysenhardt, 1821)

  • Maeotias marginata (Modeer, 1791)

  • Nemopsis bachei L. Agassiz, 1849

  • Rhizostoma pulmo (Macri, 1778)

Cténophores

  • Mnemiopsis leidyi A. Agassiz, 1865

  • Pleurobrachia pileus (O.F. Müller, 1776)

Rotifères

  • Brachionus calyciflorus Pallas, 1766

  • Brachionus plicatilis Müller, 1786

Crustacés Cladocères

  • Alona rectangula Sars, 1861

  • Bosmina (Bosmina) longirostris (O.F. Müller, 1785)

  • Bosmina (Eubosmina) coregoni Baird, 1857

  • Ceriodaphnia reticulata (Jurine, 1820)

  • Ceriodaphnia sp.

  • Daphnia sp.

  • Evadne nordmanni Lovén, 1836

  • Evadne spinifera P.E. Müller, 1867

  • Ilyocryptus sordidus (Liévin, 1848)

  • Penilia avirostris Dana, 1849

  • Podon sp.

Crustacés Copépodes

  • Acanthocyclops robustus robustus (G.O. Sars, 1863)

  • Acartia (Acanthacarcia) bifilosa (Giesbrecht, 1881)

  • Acartia (Acanthacarcia) tonsa Dana, 1849

  • Acartia (Acartiura) clausi Giesbrecht, 1889

  • Acartia (Acartiura) discaudata (Giesbrecht, 1881)

  • Alteutha interrupta (Goodsir, 1845)

  • Calanus helgolandicus (Claus, 1863)

  • Centropages chierchiae Giesbrecht, 1889

  • Centropages hamatus (Lilljeborg, 1853)

  • Centropages typicus Krøyer, 1849

  • Clytemnestra sp.

  • Cyclopina sp.

  • Cyclops spp.

  • Dactylopusia vulgaris vulgaris G.O. Sars, 1905

  • Diaixis sp.

  • Ditrichocorycaeus anglicus (Lubbock, 1857)

  • Eucyclops serrulatus serrulatus (Fisher, 1851)

  • Eudiaptomus gracilis (G.O. Sars, 1863)

  • Eurytemora affinis (Poppe, 1880)

  • Euterpina acutifrons (Dana, 1847)

  • Goniopsyllus rostratus Brady, 1883

  • Halicyclops magniceps (Lilljeborg, 1853)

  • Halicyclops neglectus neglectus Kiefer, 1935

  • Isias clavipes Boeck, 1865

  • Labidocera wollastoni (Lubbock, 1857)

  • Macrocyclops albidus (Jurine, 1820)

  • Oithona nana Giesbrecht, 1893

  • Oithona similis Claus, 1866

  • Oncaea mediterranea (Claus, 1863)

  • Oncaea venusta Philippi, 1843

  • Onychocamptus sp.

  • Paracalanus parvus (Claus, 1863)

  • Paracartia grani G.O. Sars, 1904

  • Paracyclopina nana Smirnov, 1935

  • Paracyclops fimbriatus (Fischer, 1853)

  • Parapontella brevicornis (Lubbock, 1857)

  • Parathalestris intermedia Gurney, 1930

  • Pontellina plumata (Dana, 1849)

  • Pseudocalanus elongatus (Boeck, 1865)

  • Pseudodiaptomus marinus Sato, 1913

  • Sapphirina sp.

  • Temora longicornis (O.F. Müller, 1785)

  • Temora stylifera (Dana, 1849)

Crustacés Mysidacés

  • Mesopodopsis slabberi (Van Beneden, 1861)

  • Neomysis integer (Leach, 1814)

Crustacés Amphipodes

  • Gammarus insensibilis Stock, 1966

  • Gammarus zaddachi Sexton, 1912

Chaetognathes

  • Parasagitta elegans (Verrill, 1873)

  • Sagitta sp.

Phytoplancton

13Taxons phytoplanctoniques échantillonnés dans l’estuaire de la Gironde en 1993 sur l’ensemble du gradient estuarien (Muylaert et Sabbe 1999) et entre janvier 2006 et mai 2007 en zone polyhaline et en zone mésohaline dans le cadre du projet Qualif (Y. Del Amo et A. Le Bris).

1993
Ensemble du gradient estuarien

2006-2007
Zone polyhaline (point 2)

2006-2007
Zone mésohaline (point E)

Actinoptychus senarius

Achnanthes longipes

Achnanthes longipes

Actinoptychus splendens

Amphora sp.

Actynoptychus senarius

Asterionella formosa

Asterionellopsis kariana

Amphora sp.

Asterionella glacialis

Asterionellopsis glacialis

Asterionellopsis glacialis

Aulacoseira ambigua

Asteromphalus sp.

Bellerochea malleus

Ceratium fusus

Bacillaria sp.

Chaetoceros sp.

Colacium sp.

Ceratium fusus

Coscinodiscus sp.

Cyclotella choctawatcheeana

Chaetoceros danicus

Cylindrotheca closterium

Cyclotella meneghiniana

Chaetoceros simplex

Dactyliosolen fragilissimus

Cymatosira belgica

Chaetoceros sp.

Delphineis sp.

Delphineis surirella

Coscinodiscus sp.

Dictyocha sp.

Ditylum brightwellii

Cylindrotheca closterium

Dytilum brightwellii

Euglena proxima

Dactyliosolen fragilisismus

Entomoneis sp.

Gymnodinium simplex

Delphineis sp.

Fragilaria striatula

Melosira varians

Dictyocha sp.

Fragilariopsis dodiolus

Microcystis reinboldii

Dytilum brightwellii

Fragilariopsis sp.

Navicula sp.

Entomoneis sp.

Guinardia sp.

Nitzschia sp.

Eucampia sp.

Lauderia annulata

Oocystis parva

Fragilaria striatula

Leptocylindrus danicus

Paralia sulcata

Guinardia delicatula

Manguinea sp.

Pediastrum tetras

Guinardia flaccida

Melosira nummuloides

Plagiogrammopsis vanheurckii

Guinardia sp.

Navicula sp.

Podosira stelliger

Lauderia annulata

Neodenticula seminae

Prorocentrum sp.

Leptocylindrus danicus

Nitzschia longissima

Rhaphoneis amphiceros

Leptocylindrus minimus

Nitzschia sp > 20 µm

Rhizosolenia hebetata

Lithodesmium undulatum

Paralia sulcata

Thalassiosira eccentrica

Manguinea sp.

Pediastrum simplex

Thalassiosira proschkina

Melosira nummuloides

Phaeodactylum tricornatum

Navicula sp.

Pleurosigma / Gyrosigma sp.

Nitzschia longissima

Prorocentrum sp.

Nitzschia sp. >20 µm

Pseudo-Nitzschia sp.

Odontella aurita

Raphoneis sp.

Odontella mobiliensis

Scripsiella sp.

Odontella sp.

Skeletonema sp.

Paralia sulcata

Stephanopyxis duris

Pediastrum simplex

Strombilidium spiralis

Pleurosigma / Gyrosigma sp.

Thalassionema nitzschioïdes

Prorocentrum sp.

Thalassionema sp.

Protoperidinium sp.

Thalassiosira sp. 1 < 20 µm

Pseudo-Nitzschia sp.

Thalassiosira sp. 2 > 20 µm

Raphoneis sp.

+ Euglénophycées, Nanoflagellés et Cryptophycées non identifiés

Rhizosolenia imbricata

Rhizosolenia stiliformis

Rhizosolenia sp.

Scripsiella sp.

Skeletonema sp.

Strombilidium spiralis

Thalassionema nitzschioïdes

Thalassionema sp.

Thalassiosira sp. 1 < 20 µm

Thalassiosira sp. 2 > 20 µm

+ Euglénophycées, Nanoflagellés et Cryptophycées non identifiés

Annexe 2 – Liste des habitats benthiques recensés dans l’estuaire interne et externe de la Gironde selon l’étage et le type de substrat

14Les intitulés et codes sont selon les typologies EUNIS-2012 et MNHN Version 2. Source des superficies : CARTHAM (http://cartographie.aires-marines.fr/?q=node/43) et GEREA (2016a, b) ; notées « présence » si non reportées et « - » si non individualisées par la cartographie.

Étage

Substrat

Intitulé de l’habitat

Superficie (ha)

Code EUNIS 2012

Code MNHN 2015 Version 2

Intertidal

Rocheux

Falaises, corniches, rivages et îlots rocheux sans végétation

Falaises, corniches et rivages rocheux à Angiospermes

248

B3.23

B3.31

-

-

Roches et blocs supralittoraux à lichens

Roches et blocs supralittoraux à lichens jaunes et gris

Roches et blocs supralittoraux à Hydropunctaria maura

présence

B3.11

B3.111

B3.113

R01

R01.01

R01.03

Berges artificielles enrochées

Digues en milieu marin

9,7

1 en linéaire

J2.5

J2.53

-

-

Roches et blocs du médiolittoral supérieur à très faible couverture macrobiotique

présence

A1.1

R04.01

Cirripèdes et Patelles des roches et blocs médiolittoraux

présence

A1.11

R03.01

Cirripèdes et Huîtres des roches et blocs médiolittoraux

présence

A1.11

R03.03

Roches calcaires médiolittorales à Bivalves foreurs et cryptofaune associée

présence

A1.11

R03.06

Moulières intertidales sur roches et blocs

présence

A1.111

P08.01

Roches et blocs médiolittoraux à dominance d’Algues rouges

présence

A1.12

R02.04

Fucales des roches et blocs du médiolittoral moyen

Fucales des roches et blocs du médiolittoral inférieur

présence

A1.15

R02.02

R02.03

Roches et blocs médiolittoraux à dominance animale

Plaquages de Sabellaria alveolata sur roches médiolittorales

275

A1.2

R03

R03.04

Fucales des roches et blocs du médiolittoral moyen

2

A1.31

R02.02

Roches et blocs intertidaux avec Fucales en milieu à salinité variable

9

A1.32

R06

Roches et blocs intertidaux en milieu à salinité variable à Fucus serratus et Mytilus edulis

présence

A1.326

R06.06

Récifs d’Huîtres intertidaux sur roches et blocs

3

A1.4

P10.01-02

Cuvettes en milieu rocheux de la zone médiolittorale

Cuvettes en milieu rocheux de la zone médiolittorale à Corallinales encroûtantes

présence

A1.41

A1.411

P18.02

P18.02.01

Grottes marines et surplombs intertidaux à faune encroûtante

Grottes marines et surplombs intertidaux à faune éparse

présence

A1.448

P20.01.08

P20.01.09

Récifs à Sabellaria alveolata sur roches et blocs

présence

A2.71

P12.01

Roches et blocs infralittoraux en milieu à salinité variable à Mytilus edulis

présence

A3.361

R08.09.02.01

Bancs de Modiolus barbatus

présence

A5.621

P09.03

Meuble

Sables des hauts de plage à Talitres

44

A2.211

M02.02

Galets et cailloutis intertidaux

8

A2.11

M03.01

Laisse de mer à dessiccation lente

présence

B2.12

M01

Sédiments grossiers intertidaux en milieux à salinité variable

présence

A2.12

M03.03

Sables intertidaux mobiles propres

Sables à Donax sp.

80

A2.22

-

M04.01.01

M04.01.01.03

Sables fins intertidaux dominés par les Polychètes/Amphipodes

164

A2.23

M04.02.01

Sables envasés intertidaux dominés par les Polychètes/Bivalves

Sables envasés intertidaux à Macoma balthica et Arenicola marina

Sables envasés intertidaux à Cerastoderma edule et Polychètes

57

A2.24

A2.241

A2.242

M04.02.02

M04.02.02.01

M04.02.02.02

Vases intertidales estuariennes de la slikke

Vases intertidales estuariennes dominées par les Polychètes/Bivalves

Vases intertidales estuariennes dominées par les Polychètes/Oligochètes

4264

3734

530

A2.3

A2.31

A2.32

M05.03

M05.03.01.01

M05.03.01.02

Vasières intertidales estuariennes du schorre

… haut schorre

… schorre moyen

… bas schorre

Marais salés pionniers

Laisses des marais salés

1793

7

-

-

125

-

A2.5

A2.52

A2.53

A2.54

A2.55

A2.51

M05.02

M05.02.01

M05.02.02

M05.02.03

-

-

Herbiers à Zostera noltei en milieu à salinité variable

Accumulation de débris de Zostera noltei ou autres phanérogames en laisses de mer

196

présence en linéaire

A2.611

B1.1

P01.01.02

P01.01.03

Récifs d’Huîtres intertidaux sur substrats meubles

présence

A2.7

P10.01.01

Sédiments hétérogènes envasés intertidaux à Algues vertes ou rouges éphémères

présence

A2.82

M06.02.03

Roselières à phragmites et scirpes

565

C3.21et C3.27

-

Lac de tonne

126

C1.5 et C1.6

-

Subtidal

Rocheux

Roches et blocs infralittoraux

Zones à Laminaires clairsemées dominées par Saccorhiza polyschides

Roche infralittorale en mode exposé

Roche infralittorale en mode abrité

présence

-

1309

310

A3

A3.122

A3.2

A3.3

R08

R08.05.04

-

-

Grottes marines et surplombs sublittoraux à Spongiaires encroûtants

Grottes marines et surplombs sublittoraux à Corallinales encroûtantes

présence

A3.715

A3.716

P20.02.05

P20.02.06

Meuble

Sables grossiers et graviers sublittoraux en milieux à salinité variable

409

A5.12

M08.02

Sables grossiers et graviers infralittoraux

1060

A5.13

M08.01.01

Sables fins à moyens sublittoraux en milieu à salinité variable

Sables mobiles infralittoraux en milieu à salinité variable à Neomysis integer et Gammarus spp.

12219

-

A5.22

A5.223

M09.03

M09.03.03

Sables fins propres ou envasés infralittoraux

Sables mobiles propres infralittoraux à faune éparse

Sables fins infralittoraux à Angulus tenuis

Sables fins infralittoraux à Chamelea striatula et Mactra stultorum

14229

-

-

-

A5.23

A5.231

A5.23

A5.23

M09.02.01

M09.02.01.01

M09.02.01.01.03

M09.02.01.01.04

Sables envasés infralittoraux

281

A5.24

M09.02.01.02

Sables fins légèrement envasés à Echinocardium cordatum et Ensis spp.

-

A5.241

M09.02.01.02.01

Vases infralittorales en milieu à salinité variable estuarien

Vases fluides mobiles infralittorales

Sédiments envasés infralittoraux en milieu à salinité réduite à Limnodrilus hoffmeisteri, Tubifex tubifex et Gammarus spp.

26137

-

-

A5.32

A5.324

A5.327

M10.03.02

M10.03.02.04

M10.03.02.07

Sédiments hétérogènes sublittoraux en milieu à salinité variable

408

A5.42

M11.02


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