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    Plan

    Plan détaillé Texte intégral Annexe 1 – Listes des organismes rencontrés dans l’estuaire de la Gironde, par groupe taxonomique ou écologique Phytoplancton Annexe 2 – Liste des habitats benthiques recensés dans l’estuaire interne et externe de la Gironde selon l’étage et le type de substrat

    L'estuaire de la Gironde : un écosystème altéré ?

    Ce livre est recensé par

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    Table des matières

    Annexes Partie III - Biodiversité et fonctionnement écologique

    p. 339-348

    Texte intégral Annexe 1 – Listes des organismes rencontrés dans l’estuaire de la Gironde, par groupe taxonomique ou écologique Poissons Cnidaires Némertes Annélides Oligochètes Annélides Polychètes Mollusques Polyplacophores Mollusques Bivalves Mollusques Gastéropodes Mollusques Scaphopodes Mollusques Céphalopodes Pycnogonides Crustacés Cirripèdes Crustacés Mysidacés Crustacés Cumacés Crustacés Tanaïdacés Crustacés Amphipodes Crustacés Isopodes Crustacés Euphausiacés Crustacés Décapodes Bryozoaires Echinodermes Nématodes Crustacés Ostracodes Crustacés Copépodes Appendiculaires Cnidaires Cténophores Rotifères Crustacés Cladocères Crustacés Copépodes Crustacés Mysidacés Crustacés Amphipodes Chaetognathes Phytoplancton Annexe 2 – Liste des habitats benthiques recensés dans l’estuaire interne et externe de la Gironde selon l’étage et le type de substrat

    Texte intégral

    Annexe 1 – Listes des organismes rencontrés dans l’estuaire de la Gironde, par groupe taxonomique ou écologique

    Poissons

    1Liste des 88 espèces de poissons (agnathes compris) capturées dans l’estuaire de la Gironde entre 2006 et 2016. Guildes écologiques : FW dulcicole, DIA migrateur amphihalin, ER résident estuarien, MS espèce marine saisonnière, MA espèce marine occasionnelle, MJ espèce marine juvénile. Guildes de position : D démersal, B benthique, P pélagique. Guildes trophiques : IB prédateur d’invertébrés benthiques, Z zooplanctonophage, O omnivore, IS prédateur d’invertébrés supra-benthiques, F piscivore, Par parasite. Zone de présence : D Dordogne, Gam Garonne amont, Gav Garonne aval, GAM Gironde amont, GAV Gironde aval (encart, p. 142).

    Espèce

    Nom vernaculaire

    Guilde écologique

    Guilde de position

    Guilde trophique

    Zone de présence

    Abramis brama

    Brème d’eau douce

    FW

    D

    IB

    GAM, Gam, D

    Acipenser sturio

    Esturgeon commun

    DIA

    D

    IB

    GAV, GAM, D

    Agonus cataphractus

    Souris de mer

    ER

    B

    IB

    GAV

    Alburnus alburnus

    Ablette

    FW

    P

    Z

    Gam, D

    Alosa alosa

    Alose vraie

    DIA

    P

    Z

    GAV, GAM

    Alosa fallax

    Alose feinte

    DIA

    P

    Z

    GAV, GAM, Gam, D

    Ameiurus melas

    Poisson chat

    FW

    D

    O

    GAM

    Ammodytes tobianus

    Equille

    ER

    B

    Z

    GAV

    Anguilla anguilla

    Anguille d’Europe

    DIA

    D

    O

    GAV, GAM, Gav, Gam, D

    Aphia minuta

    Nonnat

    ER

    P

    Z

    GAV

    Argyrosomus regius

    Maigre commun

    MS

    D

    IS

    GAV, GAM

    Arnoglossus thori

    Arnoglosse tacheté

    MA

    B

    IB

    GAV

    Atherina presbyter

    Prêtre

    ER

    P

    Z

    GAV

    Balistes capriscus

    Baliste

    MA

    D

    IS

    GAV

    Barbus barbus

    Barbeau fluviatile

    FW

    D

    IB

    GAM, Gam, D

    Blicca bjoerkna

    Brème bordelière

    FW

    D

    IB

    Gam, D

    Callionymus lyra

    Callionyme lyre

    ER

    B

    IB

    GAV

    Carassius carassius

    Carassin commun

    FW

    D

    O

    GAM, Gam, D

    Chelidonichthys lucernus

    Grondin perlon

    MJ

    B

    IS

    GAV

    Chelon auratus

    Mulet doré

    DIA

    D

    O

    GAV

    Chelon labrosus

    Mulet lippu

    DIA

    D

    O

    GAV

    Chelon ramada

    Mulet porc

    DIA

    D

    O

    GAV, GAM

    Ciliata mustela

    Motelle à cinq barbillons

    ER

    B

    O

    GAV

    Clupea harengus

    Hareng de l’Atlantique

    MJ

    P

    Z

    GAV

    Conger conger

    Congre d’Europe

    MA

    D

    F

    GAV

    Cyprinus carpio

    Carpe commune

    FW

    D

    O

    GAM, Gav, Gam, D

    Dasyatis pastinaca

    Pastenague

    GAV

    Dicentrarchus labrax

    Bar européen

    MJ

    D

    IS

    GAV, GAM, Gav, Gam, D

    Dicentrarchus punctatus

    Bar tacheté

    MJ

    D

    IS

    GAV

    Dicologlossa cuneata

    Céteau

    MA

    B

    IB

    GAV

    Diplodus vulgaris

    Sar commun

    MJ

    D

    IS

    GAV

    Echiichthys vipera

    Petite vive

    MA

    B

    IS

    GAV

    Engraulis encrasicolus

    Anchois

    MS

    P

    Z

    GAV, GAM, Gav

    Gadus morhua

    Morue

    GAV

    Gasterosteus aculeatus

    Epinoche à trois épines

    ER

    D

    IB

    GAV, GAM, Gav, Gam, D

    Gobius niger

    Gobie noir

    ER

    B

    IB

    GAV

    Gobius paganellus

    Gobie paganel

    ER

    B

    IB

    GAV

    Hippocampus hippocampus

    Hippocampe à museau court

    ER

    B

    Z

    GAV

    Hyperoplus lanceolatus

    Lançon commun

    MA

    D

    Z

    GAV

    Labrus bergylta

    Vieille commune

    MA

    D

    IB

    GAV

    Lampetra fluviatilis

    Lamproie fluviatile

    DIA

    P

    Par

    GAM

    Lepomis gibbosus

    Perche soleil

    FW

    D

    IS

    Gam

    Leucaspius delineatus

    Able de Heckel

    FW

    P

    Z

    Gam

    Lithognathus mormyrus

    Marbré

    MJ

    D

    IS

    GAV

    Merlangius merlangus

    Merlan

    MJ

    D

    IS

    GAV

    Merluccius merluccius

    Merlu européen

    MA

    D

    F

    GAV

    Micromesistius poutassou

    Merlan bleu

    GAV

    Mullus barbatus barbatus

    Rouget de vase

    MA

    B

    IB

    GAV

    Mullus surmuletus

    Rouget de roche

    MJ

    B

    IB

    GAV

    Pegusa lascaris

    Sole-pole

    MA

    B

    IB

    GAV

    Petromyzon marinus

    Lamproie marine

    DIA

    P

    Par

    GAV, GAM

    Platichthys flesus

    Flet d’Europe

    DIA

    B

    IB

    GAV, GAM, Gav, Gam, D

    Pleuronectes platessa

    Plie d’Europe

    MJ

    B

    IB

    GAV

    Pollachius pollachius

    Lieu jaune

    MJ

    D

    F

    GAV

    Pomatoschistus microps

    Gobie tacheté

    ER

    B

    IB

    GAM, Gav, Gam, D

    Pomatoschistus minutus

    Gobie buhotte

    ER

    B

    IB

    GAV, GAM, Gav, D

    Pomatoschistus pictus

    Gobie varié

    ER

    B

    IB

    GAV

    Psetta maxima

    Turbot

    MJ

    B

    IB

    GAV

    Pseudorasbora parva

    Pseudorasbora

    FW

    P

    O

    GAM, Gav

    Raja clavata

    Raie bouclée

    MA

    B

    IB

    GAV

    Raja microocellata

    Raie ocellée

    GAV

    Raja undulata

    Raie brunette

    MA

    B

    IB

    GAV

    Rutilus rutilus

    Gardon

    FW

    P

    O

    Gav, D

    Salmo salar

    Saumon de l’Atlantique

    DIA

    P

    IS

    GAM, GAV

    Sander lucioperca

    Sandre

    FW

    D

    F

    GAM, Gav, Gam

    Sardina pilchardus

    Sardine commune

    MJ

    P

    Z

    GAV

    Scardinius erythrophthalmus

    Rotengle

    FW

    P

    O

    Gam

    Scomber scombrus

    Maquereau

    MA

    P

    IS

    GAV

    Scophthalmus rhombus

    Barbue

    MJ

    B

    IB

    GAV

    Silurus glanis

    Silure glane

    FW

    D

    F

    GAM, Gam, D

    Solea senegalensis

    Sole sénégalaise

    MJ

    B

    IB

    GAV, GAM

    Solea solea

    Sole commune

    MJ

    B

    IB

    GAV, GAM

    Sparus aurata

    Dorade royale

    MA

    D

    IS

    GAV

    Spondyliosoma cantharus

    Griset

    MJ

    D

    IS

    GAV

    Sprattus sprattus

    Sprat

    MJ

    P

    Z

    GAV, GAM

    Squalius cephalus

    Chevaine

    FW

    P

    O

    Gam, D

    Symphodus bailloni

    Crénilabre grelue

    ER

    D

    O

    GAV

    Symphodus roissali

    Crénilabre langaneu

    ER

    D

    IS

    GAV

    Syngnathus acus

    Syngnathe aiguille

    ER

    D

    Z

    GAV

    Syngnathus rostellatus

    Syngnathe de Duméril

    ER

    P

    Z

    GAV, GAM

    Taurulus bubalis

    Chabot buffle

    MA

    B

    O

    GAM

    Torpedo marmorata

    Torpille marbrée

    MA

    B

    IB

    GAV

    Trachurus trachurus

    Chinchard d’Europe

    MJ

    P

    F

    GAV

    Trisopterus luscus

    Tacaud commun

    MJ

    D

    IS

    GAV

    Trisopterus minutus

    Capelan

    MA

    D

    IS

    GAV

    Umbrina canariensis

    Ombrine bronze

    MA

    D

    IS

    GAV

    Umbrina cirrosa

    Ombrine du large

    MA

    D

    IS

    GAV

    Uranoscopus scaber

    Uranoscope

    MA

    B

    IS

    GAV

    2D’après les données de la littérature.

    3NB : les espèces généralement associées à des substrats durs sont signalées par un *.

    Cnidaires

    • *Actinia equina (Linnaeus, 1758)

    • *Actinia fragacea Tugwell, 1856

    • *Anemonia viridis (Forsskål, 1775)

    • *Diadumene cincta Stephenson, 1925

    • *Dynamena pumila (Linnaeus, 1758)

    • *Ectopleura larynx (Ellis & Solander, 1786)

    • *Laomedea flexuosa Alder, 1857

    • *Nemertesia antennina (Linnaeus, 1758)

    Némertes

    • Tubulanus polymorphus Renier, 1804

    Annélides Oligochètes

    • Branchiura sowerbyi Beddard, 1892

    • Limnodrilus hoffmeisteri Claparède, 1862

    • Nais elinguis Müller, 1774

    • Tubifex tubifex (Müller, 1774)

    • Tubificoides benedii (d’Udekem, 1855)

    • Tubificoides brownae Brinkhurst & Baker, 1979

    • Tubificoides heterochaetus (Michaelsen, 1926)

    • Tubificoides pseudogaster (Dahl, 1960)

    Annélides Polychètes

    • Alitta succinea (Leuckart, 1847)

    • Alkmaria romijni Horst, 1919

    • Aonides oxycephala (Sars, 1862)

    • Aphelochaeta marioni (Saint Joseph, 1894)

    • Arenicola marina (Linnaeus, 1758)

    • Boccardiella ligerica (Ferronnière, 1898)

    • Capitella capitata (Fabricius, 1780)

    • Caulleriella bioculata (Keferstein, 1862)

    • Chaetozone zetlandica McIntosh, 1911

    • Cossura pygodactylata Jones, 1956

    • Diopatra biscayensis Fauchald, Berke & Woodin, 2012

    • Eulalia viridis (Linnaeus, 1767)

    • Glycera tridactyla Schmarda, 1861

    • Goniada sp.

    • Hediste diversicolor (O.F. Müller, 1776)

    • Heteromastus filiformis (Claparède, 1864)

    • Lagis koreni Malmgren, 1866

    • Lanice conchilega (Pallas, 1766)

    • Lysidice unicornis (Grube, 1840)

    • Magelona mirabilis (Johnston, 1865)

    • Malacoceros fuliginosus (Claparède, 1870)

    • Manayunkia aestuarina (Bourne, 1883)

    • Mysta picta (Quatrefages, 1866)

    • Nephtys caeca (Fabricius, 1780) ?

    • Nephtys cirrosa Ehlers, 1868

    • Nephtys hombergii Savigny in Lamarck, 1818

    • Nephtys longosetosa Oersted, 1842

    • Nereis rava Ehlers, 1868

    • Notomastus latericeus Sars, 1851

    • Ophelia neglecta Schneider, 1892

    • Paradoneis armata Glémarec, 1966 ?

    • Poecilochaetus serpens Allen, 1904

    • Polydora cornuta Bosc, 1802

    • Pseudopolydora pulchra (Carazzi, 1893)

    • Pygospio elegans Claparède, 1863

    • *Sabellaria alveolata (Linnaeus, 1767)

    • Scolelepis foliosa (Audouin & Milne Edwards, 1833)

    • Scolelepis squamata (O.F. Müller, 1806)

    • Streblospio shrubsolii (Buchanan, 1890)

    • Travisia forbesii Johnston, 1840

    Mollusques Polyplacophores

    • *Acanthochitona fascicularis (Linnaeus, 1767)

    • *Lepidochitona cinerea (Linnaeus, 1767)

    Mollusques Bivalves

    • Abra alba (W. Wood, 1802)

    • Abra segmentum (Récluz, 1843)

    • Abra tenuis (Montagu, 1803)

    • Acanthocardia aculeata (Linnaeus, 1758)

    • *Barnea candida (Linnaeus, 1758)

    • *Barnea parva (Pennant, 1777)

    • Callista chione (Linnaeus, 1758)

    • Cerastoderma edule (Linnaeus, 1758)

    • Corbicula fluminea (O.F. Müller, 1774)

    • Donax semistriatus Poli, 1795

    • Gastrana fragilis (Linnaeus, 1758)

    • Hiatella rugosa (Linnaeus, 1767)

    • Kurtiella bidentata (Montagu, 1803)

    • Limecola balthica (Linnaeus, 1758)

    • Lutraria lutraria (Linnaeus, 1758)

    • *Lyrodus pedicellatus (Quatrefages, 1849)

    • Macomangulus tenuis (da Costa, 1778)

    • Mactra stultorum (Linnaeus, 1758)

    • *Magallana angulata (Lamarck, 1819)

    • *Magallana gigas (Thunberg, 1793)

    • *Mimachlamys varia (Linnaeus, 1758)

    • *Modiolus barbatus (Linnaeus, 1758)

    • *Modiolus modiolus (Linnaeus, 1758)

    • Mya arenaria Linnaeus, 1758

    • *Mytilus edulis Linnaeus, 1758

    • *Mytilus galloprovincialis Lamarck, 1819

    • *Nototeredo norvagica (Spengler, 1792)

    • *Ostrea edulis Linnaeus, 1758

    • Parvicardium exiguum (Gmelin, 1791)

    • *Petricola lithophaga (Retzius, 1788)

    • *Pholas dactylus Linnaeus, 1758

    • Ruditapes decussatus (Linnaeus, 1758)

    • Ruditapes philippinarum (Adams & Reeve, 1850)

    • Scrobicularia plana (da Costa, 1778)

    • Solen marginatus Pulteney, 1799

    • Spisula solida (Linnaeus, 1758)

    • Spisula subtruncata (da Costa, 1778)

    • Striarca lactea (Linnaeus, 1758)

    • Venerupis corrugata (Gmelin, 1791)

    Mollusques Gastéropodes

    • Acteon tornatilis (Linnaeus, 1758)

    • Aplysia fasciata Poiret, 1789

    • Assiminea eliae Paladilhe, 1875 ?

    • Assiminea grayana J. Fleming, 1828

    • Bittium reticulatum (da Costa, 1778)

    • Brachystomia eulimoides (Hanley, 1844)

    • Colus jeffreysianus (P. Fischer, 1868)

    • *Crepidula fornicata (Linnaeus, 1758)

    • Doris verrucosa Linnaeus, 1758

    • Euspira catena (da Costa, 1778)

    • *Haliotis tuberculata Linnaeus, 1758

    • Haminoea navicula (da Costa, 1778)

    • Hydrobia acuta (Draparnaud, 1805)

    • Janthina janthina (Linnaeus, 1758)

    • Limapontia depressa Alder & Hancock, 1862

    • Littorina littorea (Linnaeus, 1758)

    • *Littorina obtusata (Linnaeus, 1758)

    • Littorina saxatilis (Olivi, 1792)

    • Megastomia conoidea (Brocchi, 1814)

    • *Melarhaphe neritoides (Linnaeus, 1758)

    • Myosotella denticulata (Montagu, 1803)

    • Myosotella myosotis (Draparnaud, 1801)

    • *Nucella lapillus (Linnaeus, 1758)

    • *Ocenebra erinaceus (Linnaeus, 1758)

    • *Patella depressa Pennant, 1777

    • *Patella pellucida Linnaeus, 1758

    • *Patella ulyssiponensis Gmelin, 1791

    • *Patella vulgata Linnaeus, 1758

    • Peringia microstoma Bourguignat, 1876 ?

    • Peringia obesa Mabille, 1877 ?

    • Peringia perieriana Bourguignat, 1876 ?

    • Peringia ulvae (Pennant, 1777)

    • Philine aperta (Linnaeus, 1767)

    • *Phorcus lineatus (da Costa, 1778)

    • Potamopyrgus antipodarum (Gray, 1843)

    • Retusa obtusa (Montagu, 1803)

    • Rissoa parva (da Costa, 1778)

    • Steromphala umbilicalis (da Costa, 1778)

    • Tritia incrassata (Ström, 1768)

    • Tritia reticulata (Linnaeus, 1758)

    • Trivia monacha (da Costa, 1778)

    • Truncatella subcylindrica (Linnaeus, 1767)

    Mollusques Scaphopodes

    • Antalis vulgaris (da Costa, 1778)

    Mollusques Céphalopodes

    • Sepiola atlantica d’Orbigny [in Férussac & d’Orbigny], 1839-1842

    Pycnogonides

    • Callipallene brevirostris (Johnston, 1837)

    Crustacés Cirripèdes

    4*Amphibalanus improvisus (Darwin, 1854)

    5*Austrominius modestus (Darwin, 1854)

    6*Balanus crenatus Bruguière, 1789

    7*Chthamalus montagui Southward, 1976

    8*Chthamalus stellatus (Poli, 1791)

    9*Perforatus perforatus (Bruguière, 1789)

    10*Semibalanus balanoides (Linnaeus, 1767)

    Crustacés Mysidacés

    • Gastrosaccus roscoffensis Bacescu, 1970

    • Gastrosaccus sanctus (Van Beneden, 1861)

    • Gastrosaccus spinifer (Goës, 1864)

    • Leptomysis lingvura (G.O. Sars, 1866)

    • Mesopodopsis slabberi (Van Beneden, 1861)

    • Neomysis integer (Leach, 1814)

    • Praunus flexuosus (Müller, 1776)

    • Praunus neglectus (G.O. Sars, 1869)

    • Schistomysis kervillei (G.O. Sars, 1885)

    • Schistomysis spiritus (Norman, 1860)

    Crustacés Cumacés

    • Cumopsis longipes (Dohrn, 1869)

    • Iphinoe trispinosa (Goodsir, 1843)

    Crustacés Tanaïdacés

    • Apseudopsis latreillii (Milne Edwards, 1828)

    Crustacés Amphipodes

    • Ampithoe valida Smith, 1873

    • Apocorophium acutum (Chevreux, 1908)

    • Apohyale prevostii (H. Milne Edwards, 1830)

    • Bathyporeia nana Toulmond, 1966

    • Bathyporeia pelagica (Spence Bate, 1856)

    • Bathyporeia pilosa Lindström, 1855

    • Bathyporeia sarsi Watkin, 1938

    • Britorchestia brito (Stebbing, 1891)

    • Caprella equilibra Say, 1818

    • Caprella penantis Leach, 1814

    • Corophium volutator (Pallas, 1766)

    • Cressa dubia (Spence Bate, 1857)

    • Echinogammarus marinus (Leach, 1815)

    • Gammaropsis maculata (Johnston, 1828)

    • Gammarus crinicornis Stock, 1966

    • Gammarus duebeni Lilljeborg, 1852

    • Gammarus insensibilis Stock, 1966

    • Gammarus salinus Spooner, 1947

    • Gammarus zaddachi Sexton, 1912

    • Haustorius arenarius (Slabber, 1769)

    • Hyale pontica Rathke, 1847

    • Hyale stebbingi Chevreux, 1888

    • Incisocalliope aestuarius (Watling & Maurer, 1973)

    • Leucothoe lilljeborgi Boeck, 1861

    • Melita nitida Smith, 1873

    • Melita palmata (Montagu, 1804)

    • Microprotopus maculatus Norman, 1867

    • Monocorophium acherusicum (Costa, 1853)

    • Nototropis guttatus Costa, 1853

    • Nototropis swammerdamei (H. Milne Edwards, 1830)

    • Pariambus typicus (Kröyer, 1844)

    • Phtisica marina Slabber, 1769

    • Pontocrates arenarius (Spence Bate, 1858)

    • Synchelidium haplocheles (Grube, 1864)

    • Urothoe pulchella (Costa, 1853)

    Crustacés Isopodes

    • Anilocra physodes (Linnaeus, 1758)

    • Cirolana cranchi Leach, 1818

    • Cyathura carinata (Krøyer, 1847)

    • Eurydice affinis Hansen, 1905

    • Eurydice pulchra Leach, 1815

    • Eurydice cf. spinigera Hansen, 1890

    • Hemioniscus balani Buchholz, 1866

    • Idotea emarginata (Fabricius, 1793)

    • *Idotea granulosa Rathke, 1843

    • Idotea linearis (Linnaeus, 1766)

    • *Idotea pelagica Leach, 1816

    • Jaera praehirsuta Forsman, 1949

    • Lekanesphaera rugicauda (Leach, 1814)

    • Sphaeroma serratum (Fabricius, 1787)

    • Synidotea laticauda Benedict, 1897

    Crustacés Euphausiacés

    • Nyctiphanes couchii (Bell, 1853)

    Crustacés Décapodes

    • Anapagurus hyndmanni (Bell, 1846)

    • Atelecyclus undecimdentatus (Herbst, 1783)

    • Athanas nitescens (Leach, 1813 [in Leach, 1813-1814])

    • Atyaephyra desmarestii (Millet, 1831)

    • Calappa granulata (Linnaeus, 1758)

    • Callinectes sapidus Rathbun, 1896

    • *Cancer pagurus Linnaeus, 1758

    • Carcinus maenas (Linnaeus, 1758)

    • *Clibanarius erythropus (Latreille, 1818)

    • Crangon crangon (Linnaeus, 1758)

    • Eriocheir sinensis H. Milne Edwards, 1853

    • Eriphia verrucosa (Forskål, 1775)

    • Eualus cranchii (Leach, 1817 [in Leach, 1815-1875])

    • Galathea intermedia Lilljeborg, 1851

    • Galathea squamifera Leach, 1814

    • *Hemigrapsus takanoi Asakura & Watanabe, 2005

    • Inachus sp.

    • Liocarcinus depurator (Linnaeus, 1758)

    • Liocarcinus holsatus (Fabricius, 1798)

    • Macropodia rostrata (Linnaeus, 1761)

    • Maja brachydactyla Balss, 1922

    • Necora puber (Linnaeus, 1767)

    • *Pachygrapsus marmoratus (Fabricius, 1787)

    • Palaemon adspersus Rathke, 1837

    • Palaemon elegans Rathke, 1837

    • Palaemon longirostris H. Milne Edwards, 1837 [in H. Milne Edwards, 1834-1840]

    • Palaemon macrodactylus Rathbun, 1902

    • Palaemon serratus (Pennant, 1777)

    • Palaemon varians Leach, 1813 [in Leach, 1813-1814]

    • Pilumnus hirtellus (Linnaeus, 1761)

    • Pilumnus spinifer H. Milne Edwards, 1834

    • Pinnotheres pisum (Linnaeus, 1767)

    • Pisa tetraodon (Pennant, 1777)

    • Pisidia longicornis (Linnaeus, 1767)

    • Planes minutus (Linnaeus, 1758) ?

    • Polybius henslowii Leach, 1820

    • *Porcellana platycheles (Pennant, 1777)

    • Procambarus clarkii (Girard, 1852)

    • Processa edulis edulis (Risso, 1816)

    • Processa parva Holthuis, 1951

    • Rhithropanopeus harrisii (Gould, 1841)

    • Xantho hydrophilus (Herbst, 1790)

    Bryozoaires

    • *Anguinella palmata Van Beneden, 1845

    • *Crisia eburnea (Linnaeus, 1758)

    • *Disporella hispida (Fleming, 1828)

    • *Microporella ciliata (Pallas, 1766)

    • *Plagioecia patina (Lamarck, 1816)

    • *Scruparia chelata (Linnaeus, 1758)

    • *Scrupocellaria scruposa (Linnaeus, 1758)

    • *Tubulipora liliacea (Pallas, 1766)

    Echinodermes

    • Asterias rubens Linnaeus, 1758

    • Echinocardium mediterraneum (Forbes, 1844)

    • Ophiura ophiura (Linnaeus, 1758)

    11D’après les données de la littérature.

    Nématodes

    • Adoncholaimus thalassophygas (de Man, 1876) Filipjev, 1918

    • Aegialoalaimus elegans de Man, 1907

    • Anoplostoma viviparum (Bastian, 1865) Bütschli, 1874

    • Antomicron elegans (de Man, 1922) De Coninck, 1965

    • Axonolaimus paraspinosus Schuurmans Stekhoven & Adam, 1931

    • Axonolaimus spinosus (Bütschli, 1874)

    • Bathylaimus sp.

    • Calyptronema maxweberi (de Man, 1922) Wieser, 1953

    • Cervonema sp.

    • Chromadora macrolaima de Man, 1889

    • Chromadorida sp.

    • Chromadorina germanica (Bütschli, 1874) Wieser, 1954

    • Cyartonema germanicum Juario, 1972

    • Daptonema spp.

    • Daptonema cf. biggi (Gerlach, 1965) Lorenzen, 1977

    • Daptonema normandicum (de Man, 1890)

    • Daptonema oxycerca (de Man, 1888)

    • Daptonema setosum (Bütschli, 1874)

    • Daptonema xyaliforme (Wieser & Hopper, 1967)

    • Dichromadora cephalata (Steiner, 1916)

    • Dichromadora geophila de Man, 1876

    • Diplolaimella sp.

    • Halalaimus gracilis de Man, 1888

    • Halalaimus sp.

    • Innocuonema tentabunda (de Man, 1890) Inglis, 1969

    • Leptolaimus papilliger de Man, 1876

    • Leptolaimus sp.

    • Linhomoeidae sp.

    • Metachromadoroides remanei (Gerlach, 1951)

    • Metalinhomoeus aff. biformis Juario, 1974

    • Monhysteridae sp.

    • Oncholaimus sp.

    • Paramonohystera sp.

    • Pareudiplogaster pararmatus (Romeyn & Bouwman, 1983)

    • Praeacanthonchus punctatus (Bastian, 1865) Micoletzky, 1924

    • Pseudolella granulifera Cobb, 1920

    • Ptycholaimellus ponticus (Filipjev, 1922) Gerlach, 1955

    • Sabatieria pulchra (Schneider, 1906)

    • Sabatieria sp.

    • Sphaerolaimus gracilis de Man, 1876

    • Sphaerolaimus hirsutus Bastian, 1865

    • Syringolaimus sp.

    • Terschellingia communis de Man, 1888

    • Terschellingia longicaudata de Man, 1907

    • Theristus sp.

    • Tobrilus diversipapillatus (Daday, 1905)

    • Tripyloides gracilis (Ditlevsen, 1918) Filipjev, 1927

    • Viscosia viscosa (Bastian, 1865) de Man, 1890

    Crustacés Ostracodes

    • Aurila convexa (Baird, 1850)

    • Candona sp.

    • Cushmanidea elongata (Brady, 1868) Puri, 1958

    • Cyprideis torosa (Jones, 1850)

    • Cyprinotus salinus (Brady, 1868)

    • Cytherois fischeri (Sars, 1866)

    • Heterocythereis albomaculata (Baird, 1838)

    • Ilyocypris gibba (Ramdohr, 1808)

    • Leptocythere castanea (Sars, 1866)

    • Loxoconcha elliptica Brady, 1868

    • Paradoxostoma sp.

    • Semicytherura sella (Sars, 1866)

    • Urocythereis oblonga (Brady, 1868) Wagner, 1957

    • Xestoleberis aurantia (Baird, 1838)

    Crustacés Copépodes

    • Amphiascoides limicola (Brady, 1899)

    • Amphiascoides subdebilis (Willey, 1935)

    • Asellopsis intermedia (T. Scott, 1895)

    • Attheyella crassa (G.O. Sars, 1863)

    • Canuella perplexa T. & A. Scott, 1893

    • Delavalia palustris Brady, 1868

    • Ectinosoma melaniceps Boeck, 1865

    • Enhydrosoma caeni Raibaut, 1965

    • Enhydrosoma gariene Gurney, 1930

    • Enhydrosoma propinquum (Brady, 1880)

    • Halectinosoma curticorne (Boeck, 1873)

    • Halectinosoma sp.

    • Harpacticus littoralis G.O. Sars, 1910

    • Microarthridion fallax Perkins, 1956

    • Microarthridion littorale (Poppe, 1881)

    • Nannopus palustris Brady, 1880

    • Nitokra lacustris (Shmankevich, 1875)

    • Paraleptastacus sp.

    • Paronychocamptus nanus (G.O. Sars, 1908)

    • Platychelipus littoralis Brady, 1880

    • Pseudobradya minor T. & A. Scott, 1895

    • Psyllocamptus propinquus (T. Scott, 1895)

    • Schizopera cf. compacta Lint, 1922

    • Schizopera pratensis Noodt, 1958

    • Schizopera sp.

    • Strongylacron buchholtzi (Boeck, 1873)

    • Tachidius discipes Giesbrecht, 1881

    12D’après les données de la littérature.

    Appendiculaires

    • Oikopleura (Vexillaria) dioica Fol, 1872

    Cnidaires

    • Blackfordia virginica Mayer, 1910

    • Liriope tetraphylla (Chamisso & Eysenhardt, 1821)

    • Maeotias marginata (Modeer, 1791)

    • Nemopsis bachei L. Agassiz, 1849

    • Rhizostoma pulmo (Macri, 1778)

    Cténophores

    • Mnemiopsis leidyi A. Agassiz, 1865

    • Pleurobrachia pileus (O.F. Müller, 1776)

    Rotifères

    • Brachionus calyciflorus Pallas, 1766

    • Brachionus plicatilis Müller, 1786

    Crustacés Cladocères

    • Alona rectangula Sars, 1861

    • Bosmina (Bosmina) longirostris (O.F. Müller, 1785)

    • Bosmina (Eubosmina) coregoni Baird, 1857

    • Ceriodaphnia reticulata (Jurine, 1820)

    • Ceriodaphnia sp.

    • Daphnia sp.

    • Evadne nordmanni Lovén, 1836

    • Evadne spinifera P.E. Müller, 1867

    • Ilyocryptus sordidus (Liévin, 1848)

    • Penilia avirostris Dana, 1849

    • Podon sp.

    Crustacés Copépodes

    • Acanthocyclops robustus robustus (G.O. Sars, 1863)

    • Acartia (Acanthacarcia) bifilosa (Giesbrecht, 1881)

    • Acartia (Acanthacarcia) tonsa Dana, 1849

    • Acartia (Acartiura) clausi Giesbrecht, 1889

    • Acartia (Acartiura) discaudata (Giesbrecht, 1881)

    • Alteutha interrupta (Goodsir, 1845)

    • Calanus helgolandicus (Claus, 1863)

    • Centropages chierchiae Giesbrecht, 1889

    • Centropages hamatus (Lilljeborg, 1853)

    • Centropages typicus Krøyer, 1849

    • Clytemnestra sp.

    • Cyclopina sp.

    • Cyclops spp.

    • Dactylopusia vulgaris vulgaris G.O. Sars, 1905

    • Diaixis sp.

    • Ditrichocorycaeus anglicus (Lubbock, 1857)

    • Eucyclops serrulatus serrulatus (Fisher, 1851)

    • Eudiaptomus gracilis (G.O. Sars, 1863)

    • Eurytemora affinis (Poppe, 1880)

    • Euterpina acutifrons (Dana, 1847)

    • Goniopsyllus rostratus Brady, 1883

    • Halicyclops magniceps (Lilljeborg, 1853)

    • Halicyclops neglectus neglectus Kiefer, 1935

    • Isias clavipes Boeck, 1865

    • Labidocera wollastoni (Lubbock, 1857)

    • Macrocyclops albidus (Jurine, 1820)

    • Oithona nana Giesbrecht, 1893

    • Oithona similis Claus, 1866

    • Oncaea mediterranea (Claus, 1863)

    • Oncaea venusta Philippi, 1843

    • Onychocamptus sp.

    • Paracalanus parvus (Claus, 1863)

    • Paracartia grani G.O. Sars, 1904

    • Paracyclopina nana Smirnov, 1935

    • Paracyclops fimbriatus (Fischer, 1853)

    • Parapontella brevicornis (Lubbock, 1857)

    • Parathalestris intermedia Gurney, 1930

    • Pontellina plumata (Dana, 1849)

    • Pseudocalanus elongatus (Boeck, 1865)

    • Pseudodiaptomus marinus Sato, 1913

    • Sapphirina sp.

    • Temora longicornis (O.F. Müller, 1785)

    • Temora stylifera (Dana, 1849)

    Crustacés Mysidacés

    • Mesopodopsis slabberi (Van Beneden, 1861)

    • Neomysis integer (Leach, 1814)

    Crustacés Amphipodes

    • Gammarus insensibilis Stock, 1966

    • Gammarus zaddachi Sexton, 1912

    Chaetognathes

    • Parasagitta elegans (Verrill, 1873)

    • Sagitta sp.

    Phytoplancton

    13Taxons phytoplanctoniques échantillonnés dans l’estuaire de la Gironde en 1993 sur l’ensemble du gradient estuarien (Muylaert et Sabbe 1999) et entre janvier 2006 et mai 2007 en zone polyhaline et en zone mésohaline dans le cadre du projet Qualif (Y. Del Amo et A. Le Bris).

    1993
    Ensemble du gradient estuarien

    2006-2007
    Zone polyhaline (point 2)

    2006-2007
    Zone mésohaline (point E)

    Actinoptychus senarius

    Achnanthes longipes

    Achnanthes longipes

    Actinoptychus splendens

    Amphora sp.

    Actynoptychus senarius

    Asterionella formosa

    Asterionellopsis kariana

    Amphora sp.

    Asterionella glacialis

    Asterionellopsis glacialis

    Asterionellopsis glacialis

    Aulacoseira ambigua

    Asteromphalus sp.

    Bellerochea malleus

    Ceratium fusus

    Bacillaria sp.

    Chaetoceros sp.

    Colacium sp.

    Ceratium fusus

    Coscinodiscus sp.

    Cyclotella choctawatcheeana

    Chaetoceros danicus

    Cylindrotheca closterium

    Cyclotella meneghiniana

    Chaetoceros simplex

    Dactyliosolen fragilissimus

    Cymatosira belgica

    Chaetoceros sp.

    Delphineis sp.

    Delphineis surirella

    Coscinodiscus sp.

    Dictyocha sp.

    Ditylum brightwellii

    Cylindrotheca closterium

    Dytilum brightwellii

    Euglena proxima

    Dactyliosolen fragilisismus

    Entomoneis sp.

    Gymnodinium simplex

    Delphineis sp.

    Fragilaria striatula

    Melosira varians

    Dictyocha sp.

    Fragilariopsis dodiolus

    Microcystis reinboldii

    Dytilum brightwellii

    Fragilariopsis sp.

    Navicula sp.

    Entomoneis sp.

    Guinardia sp.

    Nitzschia sp.

    Eucampia sp.

    Lauderia annulata

    Oocystis parva

    Fragilaria striatula

    Leptocylindrus danicus

    Paralia sulcata

    Guinardia delicatula

    Manguinea sp.

    Pediastrum tetras

    Guinardia flaccida

    Melosira nummuloides

    Plagiogrammopsis vanheurckii

    Guinardia sp.

    Navicula sp.

    Podosira stelliger

    Lauderia annulata

    Neodenticula seminae

    Prorocentrum sp.

    Leptocylindrus danicus

    Nitzschia longissima

    Rhaphoneis amphiceros

    Leptocylindrus minimus

    Nitzschia sp > 20 µm

    Rhizosolenia hebetata

    Lithodesmium undulatum

    Paralia sulcata

    Thalassiosira eccentrica

    Manguinea sp.

    Pediastrum simplex

    Thalassiosira proschkina

    Melosira nummuloides

    Phaeodactylum tricornatum

    Navicula sp.

    Pleurosigma / Gyrosigma sp.

    Nitzschia longissima

    Prorocentrum sp.

    Nitzschia sp. >20 µm

    Pseudo-Nitzschia sp.

    Odontella aurita

    Raphoneis sp.

    Odontella mobiliensis

    Scripsiella sp.

    Odontella sp.

    Skeletonema sp.

    Paralia sulcata

    Stephanopyxis duris

    Pediastrum simplex

    Strombilidium spiralis

    Pleurosigma / Gyrosigma sp.

    Thalassionema nitzschioïdes

    Prorocentrum sp.

    Thalassionema sp.

    Protoperidinium sp.

    Thalassiosira sp. 1 < 20 µm

    Pseudo-Nitzschia sp.

    Thalassiosira sp. 2 > 20 µm

    Raphoneis sp.

    + Euglénophycées, Nanoflagellés et Cryptophycées non identifiés

    Rhizosolenia imbricata

    Rhizosolenia stiliformis

    Rhizosolenia sp.

    Scripsiella sp.

    Skeletonema sp.

    Strombilidium spiralis

    Thalassionema nitzschioïdes

    Thalassionema sp.

    Thalassiosira sp. 1 < 20 µm

    Thalassiosira sp. 2 > 20 µm

    + Euglénophycées, Nanoflagellés et Cryptophycées non identifiés

    Annexe 2 – Liste des habitats benthiques recensés dans l’estuaire interne et externe de la Gironde selon l’étage et le type de substrat

    14Les intitulés et codes sont selon les typologies EUNIS-2012 et MNHN Version 2. Source des superficies : CARTHAM (http://cartographie.aires-marines.fr/?q=node/43) et GEREA (2016a, b) ; notées « présence » si non reportées et « - » si non individualisées par la cartographie.

    Étage

    Substrat

    Intitulé de l’habitat

    Superficie (ha)

    Code EUNIS 2012

    Code MNHN 2015 Version 2

    Intertidal

    Rocheux

    Falaises, corniches, rivages et îlots rocheux sans végétation

    Falaises, corniches et rivages rocheux à Angiospermes

    248

    B3.23

    B3.31

    -

    -

    Roches et blocs supralittoraux à lichens

    Roches et blocs supralittoraux à lichens jaunes et gris

    Roches et blocs supralittoraux à Hydropunctaria maura

    présence

    B3.11

    B3.111

    B3.113

    R01

    R01.01

    R01.03

    Berges artificielles enrochées

    Digues en milieu marin

    9,7

    1 en linéaire

    J2.5

    J2.53

    -

    -

    Roches et blocs du médiolittoral supérieur à très faible couverture macrobiotique

    présence

    A1.1

    R04.01

    Cirripèdes et Patelles des roches et blocs médiolittoraux

    présence

    A1.11

    R03.01

    Cirripèdes et Huîtres des roches et blocs médiolittoraux

    présence

    A1.11

    R03.03

    Roches calcaires médiolittorales à Bivalves foreurs et cryptofaune associée

    présence

    A1.11

    R03.06

    Moulières intertidales sur roches et blocs

    présence

    A1.111

    P08.01

    Roches et blocs médiolittoraux à dominance d’Algues rouges

    présence

    A1.12

    R02.04

    Fucales des roches et blocs du médiolittoral moyen

    Fucales des roches et blocs du médiolittoral inférieur

    présence

    A1.15

    R02.02

    R02.03

    Roches et blocs médiolittoraux à dominance animale

    Plaquages de Sabellaria alveolata sur roches médiolittorales

    275

    A1.2

    R03

    R03.04

    Fucales des roches et blocs du médiolittoral moyen

    2

    A1.31

    R02.02

    Roches et blocs intertidaux avec Fucales en milieu à salinité variable

    9

    A1.32

    R06

    Roches et blocs intertidaux en milieu à salinité variable à Fucus serratus et Mytilus edulis

    présence

    A1.326

    R06.06

    Récifs d’Huîtres intertidaux sur roches et blocs

    3

    A1.4

    P10.01-02

    Cuvettes en milieu rocheux de la zone médiolittorale

    Cuvettes en milieu rocheux de la zone médiolittorale à Corallinales encroûtantes

    présence

    A1.41

    A1.411

    P18.02

    P18.02.01

    Grottes marines et surplombs intertidaux à faune encroûtante

    Grottes marines et surplombs intertidaux à faune éparse

    présence

    A1.448

    P20.01.08

    P20.01.09

    Récifs à Sabellaria alveolata sur roches et blocs

    présence

    A2.71

    P12.01

    Roches et blocs infralittoraux en milieu à salinité variable à Mytilus edulis

    présence

    A3.361

    R08.09.02.01

    Bancs de Modiolus barbatus

    présence

    A5.621

    P09.03

    Meuble

    Sables des hauts de plage à Talitres

    44

    A2.211

    M02.02

    Galets et cailloutis intertidaux

    8

    A2.11

    M03.01

    Laisse de mer à dessiccation lente

    présence

    B2.12

    M01

    Sédiments grossiers intertidaux en milieux à salinité variable

    présence

    A2.12

    M03.03

    Sables intertidaux mobiles propres

    Sables à Donax sp.

    80

    A2.22

    -

    M04.01.01

    M04.01.01.03

    Sables fins intertidaux dominés par les Polychètes/Amphipodes

    164

    A2.23

    M04.02.01

    Sables envasés intertidaux dominés par les Polychètes/Bivalves

    Sables envasés intertidaux à Macoma balthica et Arenicola marina

    Sables envasés intertidaux à Cerastoderma edule et Polychètes

    57

    A2.24

    A2.241

    A2.242

    M04.02.02

    M04.02.02.01

    M04.02.02.02

    Vases intertidales estuariennes de la slikke

    Vases intertidales estuariennes dominées par les Polychètes/Bivalves

    Vases intertidales estuariennes dominées par les Polychètes/Oligochètes

    4264

    3734

    530

    A2.3

    A2.31

    A2.32

    M05.03

    M05.03.01.01

    M05.03.01.02

    Vasières intertidales estuariennes du schorre

    … haut schorre

    … schorre moyen

    … bas schorre

    Marais salés pionniers

    Laisses des marais salés

    1793

    7

    -

    -

    125

    -

    A2.5

    A2.52

    A2.53

    A2.54

    A2.55

    A2.51

    M05.02

    M05.02.01

    M05.02.02

    M05.02.03

    -

    -

    Herbiers à Zostera noltei en milieu à salinité variable

    Accumulation de débris de Zostera noltei ou autres phanérogames en laisses de mer

    196

    présence en linéaire

    A2.611

    B1.1

    P01.01.02

    P01.01.03

    Récifs d’Huîtres intertidaux sur substrats meubles

    présence

    A2.7

    P10.01.01

    Sédiments hétérogènes envasés intertidaux à Algues vertes ou rouges éphémères

    présence

    A2.82

    M06.02.03

    Roselières à phragmites et scirpes

    565

    C3.21et C3.27

    -

    Lac de tonne

    126

    C1.5 et C1.6

    -

    Subtidal

    Rocheux

    Roches et blocs infralittoraux

    Zones à Laminaires clairsemées dominées par Saccorhiza polyschides

    Roche infralittorale en mode exposé

    Roche infralittorale en mode abrité

    présence

    -

    1309

    310

    A3

    A3.122

    A3.2

    A3.3

    R08

    R08.05.04

    -

    -

    Grottes marines et surplombs sublittoraux à Spongiaires encroûtants

    Grottes marines et surplombs sublittoraux à Corallinales encroûtantes

    présence

    A3.715

    A3.716

    P20.02.05

    P20.02.06

    Meuble

    Sables grossiers et graviers sublittoraux en milieux à salinité variable

    409

    A5.12

    M08.02

    Sables grossiers et graviers infralittoraux

    1060

    A5.13

    M08.01.01

    Sables fins à moyens sublittoraux en milieu à salinité variable

    Sables mobiles infralittoraux en milieu à salinité variable à Neomysis integer et Gammarus spp.

    12219

    -

    A5.22

    A5.223

    M09.03

    M09.03.03

    Sables fins propres ou envasés infralittoraux

    Sables mobiles propres infralittoraux à faune éparse

    Sables fins infralittoraux à Angulus tenuis

    Sables fins infralittoraux à Chamelea striatula et Mactra stultorum

    14229

    -

    -

    -

    A5.23

    A5.231

    A5.23

    A5.23

    M09.02.01

    M09.02.01.01

    M09.02.01.01.03

    M09.02.01.01.04

    Sables envasés infralittoraux

    281

    A5.24

    M09.02.01.02

    Sables fins légèrement envasés à Echinocardium cordatum et Ensis spp.

    -

    A5.241

    M09.02.01.02.01

    Vases infralittorales en milieu à salinité variable estuarien

    Vases fluides mobiles infralittorales

    Sédiments envasés infralittoraux en milieu à salinité réduite à Limnodrilus hoffmeisteri, Tubifex tubifex et Gammarus spp.

    26137

    -

    -

    A5.32

    A5.324

    A5.327

    M10.03.02

    M10.03.02.04

    M10.03.02.07

    Sédiments hétérogènes sublittoraux en milieu à salinité variable

    408

    A5.42

    M11.02

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    Sautour, Benoît, et Jérôme Baron, éd. « Annexes Partie III - Biodiversité et fonctionnement écologique ». In L’estuaire de la Gironde : un écosystème altéré ?. Pessac: Presses Universitaires de Bordeaux, 2020. doi:10.4000/books.pub.45395.
    Sautour, Benoît, et Jérôme Baron, éditeurs. « Annexes Partie III - Biodiversité et fonctionnement écologique ». L’estuaire de la Gironde : un écosystème altéré ?, Presses Universitaires de Bordeaux, 2020, https://doi.org/10.4000/books.pub.45395.

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    Sautour, Benoît, et Jérôme Baron, éditeurs. L’estuaire de la Gironde : un écosystème altéré ?. Presses Universitaires de Bordeaux, 2020, https://doi.org/10.4000/books.pub.44868.
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