Introduction
p. 120
Texte intégral
1Il n’est pas nécessaire de préciser qu’avoir lu la première partie de ce manuel avant d’attaquer la partie pratique facilitera grandement la lecture et la compréhension de cette section, même si on peut très bien commencer directement ici. Je considérerai les notions de génétique des populations et de statistiques utilisées comme un minimum connues. Je ne m’étendrai donc jamais sur un concept ou une notion. Dans le doute, les lecteurs sont invités à se référer aux chapitres de la partie précédente de ce manuel.
2Tous les jeux de données utilisés dans cette partie sont disponibles sur internet, à télécharger sur mon site web à http://www.t-de-meeus.fr/Data/DataLivreInitiation/Data.html. Tous les logiciels utilisés ou presque sont gratuits. En ce qui me concerne, j’utilise Excel (Microsoft corporation) pour gérer mes données, faire des calculs (transformations de données, par exemple) et des graphiques (comme des courbes). Pour les analyses statistiques classiques, j’utilise des logiciels commerciaux dont j’ai la licence. Cependant, dans un souci de libre accès à tous, j’ai essayé d’adapter tous les tests utilisés pour des logiciels gratuits (voir la liste des logiciels et URL de téléchargement en annexe).
3Tous les jeux de données analysés ont fait l’objet d’articles publiés dans des revues scientifiques. Cependant, toutes les analyses présentées dans ce manuel n’ont pas été publiées pour des contraintes d’espace et de lisibilité des articles. On ne publie en général pas les simulations et/ou analyses annexes redondantes que l’on peut être amené à faire pour vérifier la robustesse de certains résultats. Certaines améliorations, comme l’utilisation d’une méthode plus puissante non disponible à l’époque de l’article, ou parce que je n’y avais simplement pas pensé à l’époque, sont également présentées dans certains traitements des données et donc certaines conclusions peuvent parfois être quelque peu modifiées par rapport à l’article princeps.
4Pour cette réédition, j’ai choisi de modifier le moins possible les analyses, sauf quand j’y ai rencontré des résultats qui méritaient d’être ajustés ou même corrigés. Pour ce qui concerne les fichiers à télécharger, l’adresse de mon site web a changé car le service informatique de l’IRD n’a pas voulu continuer à héberger mon site web pour des raisons qui ne m’ont jamais été transmises. Il est maintenant hébergé à http://www.t-de-meeus.fr/TdeMeeus.html.
5Une synthèse des nouvelles analyses et discussion des différences seront présentées à la fin de chaque section.
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Tiques et maladies à tiques
Biologie, écologie évolutive, épidémiologie
Karen D. McCoy et Nathalie Boulanger (dir.)
2015
Initiation à la génétique des populations naturelles
Applications aux parasites et à leurs vecteurs
Thierry De Meeûs
2012
Audit des décès maternels dans les établissements de santé
Guide de mise en oeuvre
Alexandre Dumont, Mamadou Traoré et Jean-Richard Dortonne (dir.)
2014
Les anophèles
Biologie, transmission du Plasmodium et lutte antivectorielle
Pierre Carnevale et Vincent Robert (dir.)
2009
Les champignons ectomycorhiziens des arbres forestiers en Afrique de l’Ouest
Méthodes d’étude, diversité, écologie, utilisation en foresterie et comestibilité
Amadou Bâ, Robin Duponnois, Moussa Diabaté et al.
2011
Lutte contre la maladie du sommeil et soins de santé primaire
Claude Laveissière, André Garcia et Bocar Sané
2003