1 Villanueva Urteaga, Horacio ″Fundación de la Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cuzco, Publicación en Homenaje al Tricentenario de la Fundación de la Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cuzco. 1692-1992. Cuzco 1987. "El Seminario de San Antonio Abad del Cuzco″ y ″El Colegio San Bernardo del Cuzco″ en Revista Peruana de Historia Eclesiástica. Instituto Peruano de Historia Eclesiástica. Cuzco 1989. En este primer número de la Revista se incluyen pequeños artículos de diferentes historiadores sobre los Seminarios de Santo Toribio de Lima, San Jerónimo de Arequipa, San Carlos y San Marcelo de Trujillo, San Cristóbal de Huamanga, y Colegios de San Pablo y de San Martín, San Ildefonso, San Buenaventura, Santo Tomás de Aquino, San Pedro Nolasco, Real Convictorio de San Carlos, y Colegio de Propaganda Fide de Ocopa.
2 Vargas Ugarte, Rubén S.J. ″Historia de la Compañia de Jesús en el Perú″ 4 Tomos. Ed. Burgos. 1963.
3 Vargas Ugarte, Rubén ob. cit. pág. 209-239.
4 Pacheco, Fernando ″Noticias Cronóligas del Cuco″ (1887) Ed. Lima 1902.
5 Cobo, Bernabé ob. cit. La ubicación está tomada de la relación que hace el Rector del Colegio en 1724 padre Sebastián Villa. A.H.N.S.A.A.C. Segunda Sala. Estante No. 1 Top 12. E. 8 págs. 34-39.
6 Revista Histórica del Cuzco. No. 8 Año 1957. págs. 173-187.
7 A.H. UNSAAC Seg. Sala. Estante No. 1. Top. 12. E. 8. fs. 34-39.
8 El Colegio se quejaba de que la Marquesa de La Laguna había ordenado romper y desbaratar la cañería que pasaba por su casa. Vargas Ligarte, ob. cit. pág. 226. revista del archivo histórico del cuzco. No. 8 pág. 188.
9 A.H. UNSAAC. Seg. Sala Estante No. 1 Top. 12. E. 8 fs. 34-39.
10 Ibidem.
11 Anónimo. ″Breve relación de lo sucedido en el Colegio del Cuzco desde el año de 1600 hasta el presente de 1653 que se había de haber puesto en este libro por diarios de años y meses, según los sucesos notables que ha habido y en los Rectorados de los PR Rectores y por la incuria de los tiempos no se han escrito ni había memoria de ellas en alguna otra parte siendo tan dignas de ella″. Historia del Colegio y Universidad del Cuzco. Biblioteca Histórica Peruana. Publicación del Instituto de Investigaciones Históricas. T. IV págs. 129 t 150. Lima 1948.
12 A.H. UNSAAC. Seg. Sala Estante No. 1 Top 12 E. 8 pág. 34-39.
13 En una nota de su libro Vargas Ugarte señala que en el expediente seguido por los indios Comisarios de Nobles y Caciques de la ciudad del Cuzco sobre el lamentable estado en que se hallaba el Colegio de S. Borja, en el fol. 67, dice, se da la nómina de los caciques colegiales que en la fecha, 27 de Octubre de 1735, vivían en el Colegio siendo Rector el P Tomás de Figueroa. Eran 39 en total y procedían de las diversas provincias del Cuzco. Al principio se dice que el primer colegial cacique fue D. Felipe Huáscar, hijo legítimo del Inca Huáscar y que los nombres de los demás no constan en libro alguno. Ob. cit. pág. 226.
14 A.H. UNSAAC. Doc. cit. Top. 12. E. 8 fs. cits.
15 Vargas Ligarte, Rubén ob. cit. pág. 212.
16 Ibidem.
17 Vargas Ugarte, ob. cit. pág. 332.
18 A.H. UNSAAC. Seg. Sala Estante No. 1. Top 45. fs. 1-3. El Colegio llevaba los registros de pago de los censos en unos libros encuadernados en badana colorada donde se guarda la además todas las Provisiones que se habían hecho al Colegio. El Libro Primero tenía pintadas las Armas Reales en la tapa.
19 El censo era una imposición pecuniaria a una comunidad de indios o a alguna hacienda de españoles. En el caso del censo a comunidades indígenas, éstos eran impuestos por Cédula Virreinal, en el caso de censos a las haciendas éstos eran impuestos por voluntad de los propietarios de las haciendas y estaban destinados a algún monasterio, convento u orden religiosa, como una limosna a la Iglesia.
20 Ib. El documento de 1622 establece claramente que el monto que instituyó Toledo era de 50.000 pesos y no 5.000 y que los indios eran 500 y no 50. Nos parecen exageradas las cifras de modo que las hemos tenido un cero en ambos casos.
21 2.000 ducados equivalían entonces a 2.750 pesos de a 8 reales.
22 Archivo Histórico de la UNSAAC Segunda Sala. Estante ñ. 1. Top 12. Años 1600-1687. E. 7.
23 Petición de Testimonio sobre 17 preguntas. A.H.U.N.A.A.C. Seg. Sala. Estante No. 1 Top 12 E. 8 Top. 12 págs. 34-39. Es a través de este documento que tenemos muchos detalles sobre el funcionamiento, acomodo y adorno que tenía el Colegio.
24 Macera, Pablo: Instrucciones para el manejo de las haciendas jesuíticas del Perú″ s. xvii-xviii. UNMSM, Lima. 1966, citado por Gutiérrez y otros en ″Notas sobre las haciendas del Cuzco″ pág. 30. Ed. Fundación para la Educación, la Ciencia y la Cultura. Buenos Aires, 1984.
25 Escóbar de Querejazu, Laura ″Producción y Comercio en el Espacio Sur Andino″ Col. Arsanz y Vela. Publicación de la Embajada de España en Bolivia″. La Paz 1985.
26 Acosta, Antonio ″La extirpación de las idolatrías en el Perú. Origen y desarrollo de las campañas. A propósito de "Cultura Andina y represión″ de Pierre Duviols. Revista Andina No. 9). págs. 171-195. Julio 1989. Centro Bartolomé de Las Casas. Cuzco.
27 Archivo Histórico Universidad de San Antonio Abad del Cuzco. Documentos relativos a los Colegios S. Bernardo y S. Francisco de Borja y fundación de estos Colegios. Top. 45. ff. 1-2-3. Seg. Sala. Estante No. 1.